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伤寒沙门菌长链非编码RNA AS-RpoH分子鉴定
  • ISSN号:1671-7783
  • 期刊名称:《江苏大学学报:医学版》
  • 时间:0
  • 分类:R378.22[医药卫生—病原生物学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:江苏大学医学院,江苏镇江212013
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(81371780); 江苏省研究生创新计划资助项目(CXLX13_692)
中文摘要:

目的:探讨伤寒沙门菌非编码RNA AS-RpoH的分子特性,为进一步研究其调控功能和机制奠定基础。方法:在AS-RpoH表达高峰区设计特异性探针,运用RNA印迹检测AS-RpoH的表达;通过PCR寻找AS-RpoH可能的转录起始位点和终止位点;在yhhk编码区设计特异性探针,运用RNA印迹分析yhhk的转录产物。结果:RNA印迹结果显示,AS-RpoH在沙门菌中确实存在,长约3 000 nt;PCR结果表明,AS-RpoH的转录终止位点位于rpo H基因起始密码子上游191-238 nt之间;而其转录起始位点可能位于yhh K上游;RNA印迹分析结果表明yhh K基因的转录产物与AS-RpoH的长度一致。结论:长链非编码RNA AS-RpoH在伤寒沙门菌中存在表达,可能为yhh K的3'非翻译区。

英文摘要:

Objective: To clarify the molecular characteristics of a non-coding RNA,AS-RpoH in Salmonella enterica serovar Typhi( S. Typhi). Methods: Northern blotting analysis was used to investigate the expression of AS-RpoH in S. Typhi; RT-PCR was used to identify the possible transcription initiation and termination sites of AS-RpoH; Northern blotting analysis with specific probe was used to analyze the transcripts of yhhK. Results: The AS-RpoH expression was confirmed by Northern blotting with a length of approximate 3 000 nt; The transcription termination site of AS-RpoH was located in the region between 191-238 nucleotides of rpo H start codon upstream; The possible initiation site of AS-RpoH transcription was located on the upstream of yhhK; Northern blotting analysis revealed that the length of yhhK transcript was the same as the length of AS-RpoH. Conclusion: AS-RpoH is one of long non-coding RNAs expressed in S. Typhi,which may be a possible 3'-untranslation region of the yhhK.

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期刊信息
  • 《江苏大学学报:医学版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:江苏省教育厅
  • 主办单位:江苏大学
  • 主编:许化溪
  • 地址:江苏省镇江市梦溪园巷30号
  • 邮编:212003
  • 邮箱:
  • 电话:0511-84446824
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-7783
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1669/R
  • 邮发代号:28-192
  • 获奖情况:
  • 1995年、1999年被评为江苏省优秀学报
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊
  • 被引量:6001