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濒危植物珙桐AFLP反应体系的建立及引物筛选
  • ISSN号:0439-8114
  • 期刊名称:湖北农业科学
  • 时间:2012
  • 页码:831-834
  • 分类:S792.99[农业科学—林木遗传育种;农业科学—林学] Q503[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]河南科技大学林学院,河南洛阳471003, [2]广西大学林学院,南宁530004
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31060053); 河南科技大学博士科研启动基金(09001377) 河南科技大学青年基金项目(13090063)
  • 相关项目:生物质能源物种掌叶木的生殖衰退与濒危机制研究
中文摘要:

为研究不同生境下珙桐(Davidia involucrata Baill.)的遗传多样性,以珙桐叶片为材料优化建立珙桐的AFLP反应体系。对酶切与连接中DNA的浓度、预扩增的引物、选择扩增中Mg2+和dNTPs的浓度进行梯度比较分析。结果显示,酶切与连接过程中DNA的浓度变化对结果影响不大,预扩增的引物是否带有选择碱基对结果影响明显,选择扩增中dNTPs浓度的变化对最终谱带影响不大,而Mg2+浓度变化会对最终谱带产生影响,以1.75 mmol/L为宜。采用优化后的体系,从12对Mse I、EcoR I引物的144组AFLP选择扩增引物组合中筛选出能够得到清晰扩增谱带的7组引物组合,为今后的研究奠定了基础。

英文摘要:

To study the genetic diversity of Davidia involucrata Baill.grow in different habitats,an AFLP-PCR system using the leaves of D.involucrata as material was established and optimized.The effects of main elements,including temple concentration for enzyme digestion and connection,primers for pre-amplification,dNTPs and Mg2+ concentration,for selective amplification were tested.The results showed that the influence of DNA concentration and dNTPs concentration was slender;while the primers and concentration of Mg2+ had significant effects on the reaction.The optimal Mg2+ concentration in selective amplification was 1.75 mmol/L.7 combinations of primers with clear PCR bands were selected out of 144 combinations of 12 pairs of Mse I,EcoR I primers for further study.

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期刊信息
  • 《湖北农业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:湖北省农业科学院
  • 主办单位:湖北省农业科学院 华中农业大学 长江大学
  • 主编:焦春海
  • 地址:武汉市武昌南湖瑶苑1号省农业科学院内
  • 邮编:430064
  • 邮箱:hbnykxxzz@126.com
  • 电话:027-87389334
  • 国际标准刊号:ISSN:0439-8114
  • 国内统一刊号:ISSN:42-1255/S
  • 邮发代号:38-21
  • 获奖情况:
  • 国家期刊奖,全国农业核心期刊,湖北省优秀期刊,中国期刊方阵“双高”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:30537