位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
Nest—PCR和PCR—RFLP在恶性疟原虫地理株基因分型及多态性研究中的应用
  • ISSN号:1000-7423
  • 期刊名称:《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R382.312[医药卫生—医学寄生虫学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]同济大学传染病与疫苗研究所,上海200092
  • 相关基金:国家973重点基础研究发展计划(No.2007CB513100)
中文摘要:

目的分析套式PCR(nest-PCR)和限制性内切酶片段长度多态性(PCR-RFLP)方法在恶性疟原虫地理株裂殖子表面蛋白(MSP2)基因多态性研究中的分型效率及特异性。方法分别在海南省三亚市和云南省腾冲县等地通过静脉采血法采集疟疾患者血样98份,其中恶性疟88份,间日疟10份。另从上海地区的健康人群中抽取10份血样作为阴性对照。用nest-PCR和PCR-RFLP方法分别对疟原虫地理株进行MSP2等位基因分型,并对分型结果进行归纳和比较分析。结果常规nest-PCR方法对于恶性疟原虫地理株MSP2等位基因的总检出效率为79.8%(166/208),其中,对于FC27家族等位基因的检出效率为92.7%(101/109),但对3D7家族等位基因的检出率仅为65.7%(65/99),且无法鉴定具体的等位基因。PCR-RFLP分型法检出效率比nest-PCR法提高了20.2%,且特异性好。结论PCR-RFLP相对于常规的nest-PCR分型法具有检出效率、分辨率和特异性皆高的优点,可以鉴定地理株中具体的等位基因类型。

英文摘要:

Objective To analyze the efficiency and specificity of MSP2 alleles genotyping for Plasmodium falciparum isolates by Nest-PCR and PCR-RFLP. Methods MSP2 alleles from Plasmodium falciparum isolates of Yunnan and Hainan were genotyped by Nest-PCR and PCR-RFLP, respectively, and the efficiency and specificity of the two methods were analyzed. Results The conventional Nest-PCR method could detect 79.8% (166/208) alleles of MSP2, and 65.7% (65/99) for 3D7 family, but could not identify the type of any allele. While PCR-RFLP showed 25.3% higher genotyping efficiency than Nest-PCR. Moreover, this method could identify the allele types. Conclusion PCR- RFLP genotyping technique is more efficient and specific than conventional Nest-PCR, and it is a convenient tool in the study on molecular epidemiology of malaria.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:中华预防医学会 中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所
  • 主编:汤林华
  • 地址:上海市瑞金二路207号右楼3F
  • 邮编:200025
  • 邮箱:zgjsczz@vip.163.net
  • 电话:021-54562376
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-7423
  • 国内统一刊号:ISSN:31-1248/R
  • 邮发代号:4-362
  • 获奖情况:
  • 1997年被中华预防医学会评为先进编辑部,2000年荣获中华预防医学会系列杂志优秀期刊一等奖,2001年荣获中华预防医学会2001年优秀期刊二等奖,2003年荣获2001-2002年中华预防医学会系列杂志优...,2009年获“百种中国杰出学术期刊”奖,2010年荣获上海市科技期刊审计优秀奖,2011年遴选为第二届“中国精品科技期刊”,获第三届“RCCSE中国权威学术期刊”,2013年荣获国家卫生计生委首届优秀期刊,2013年荣获第四届华东地区优秀期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:11792