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水稻籽粒蛋白双向电泳条件的优化及其蛋白组学方法的比较
  • ISSN号:0496-3490
  • 期刊名称:《作物学报》
  • 时间:0
  • 分类:S512.101[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]福建农林大学生命科学学院农业生态研究所/福建农林大学作物生理与分子生态重点实验室,福建福州350002
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30871494); 教育部博士点基金(200803890006); 福建省自然科学基金(2007J0304 2008J0042); 福建省重点学科经费资助
中文摘要:

探讨适用于籽粒蛋白组学研究的策略,对深入研究籽粒的发育过程具有重要的意义。本文对比了3种不同的蛋白提取方法,优化了双向电泳中自制管胶一向的等电聚焦条件和IPG干胶条一向的等电聚焦时间,以MALDI-TOF/MS、Western blot和磷酸化蛋白组学3个重要的蛋白质组学研究方法对胶内蛋白质鉴定分析。结果表明,可溶性蛋白提取法最适用于籽粒蛋白组学的研究;电泳条件优化后,得到了较优的2-DE图谱;胶内蛋白点适用于质谱分析、蛋白表达量验证(Western blot)及籽粒蛋白的磷酸化组学的研究。本研究为下一步在蛋白组水平上分析籽粒发育提供了技术支持。

英文摘要:

A suitable proteomic strategy for rice grain protein research is important for further understanding rice grain development at proteome level.In this study,three different protein extraction methods were compared and then electrophoretic conditions of hand-made gel lands and IPG lands in IEF(isoelectric focusing)were optimized.Furthermore,three important proteomic research strategies(MALDI-TOF/MS,western-blot and phosphoproteome)were used for identification and analysis of in-gel proteins.The results showed that the method of soluble protein extraction was most suitable for investigation of grain proteomics,with a well-distributed 2-DE gel profile under optimized electrophoretic conditions,and it was confirmed that MALDI-TOF/MS,western-blot and phosphoproteome were the three suitable methods for the analysis of in-gel proteins.The establishment of the suitable system for rice grain proteomic research paves the way for the next step to further analyse rice grain development at proteome level.

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期刊信息
  • 《作物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国作物学会 中国农业科学院作物科学研究所
  • 主编:万建民
  • 地址:北京海淀区中关村南大街12号中国农业科学院
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zwxb301@caas.cn
  • 电话:010-82108548
  • 国际标准刊号:ISSN:0496-3490
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1809/S
  • 邮发代号:82-336
  • 获奖情况:
  • 2002年-第三届中国科协优秀科技期刊二等奖,2002-2009年-百种中国杰出学术期刊,2004年获“全国优秀期刊一等奖”,2005年获第三届国家期刊奖提名奖,2009年评为“2008年度中国精品科技期刊”,2009年被评为“新中国60年有影响力的期刊”,2011年获"第二届中国出版政府奖期刊奖提名奖"
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:49369