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基因表达调控与选择性剪接机制研究
  • ISSN号:0372-2112
  • 期刊名称:《电子学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q11[生物学—普通生物学]
  • 作者机构:清华大学生物信息研究所智能技术与系统国家重点实验室,北京,100084 清华大学生物信息研究所智能技术与系统国家重点实验室,北京,100084
  • 相关基金:国家自然科学基金(NO.69872018,69935020);北京市科技合同项目(No.9550213000);清华大学基础和创新研究基金
作者: 闻芳, 李衍达
中文摘要:

随着人类基因组计划(HGP)的完成,生物信息学的研究进入了后基因组时代,用计算方法对基因表达调控和基因功能进行研究成为生物信息学研究的核心内容.由于在真核基因表达调控中的特殊地位,选择性剪接成为研究真核基因表达调控的重要内容之一.本文从收集选择性剪接基因的数据出发,尽可能的收集已知的选择性剪接的基因和它们的各种转录产物,并进行了适当的筛选以保证数据的质量和统计分析的可靠性.对挑选出的371个人类基因,提取各种转录产物的编码区(coding regions,或简称cds),应用一种新的针对选择性剪接的多序列比对程序ASALIGN进行多序列比对来揭示不同cds间的剪接关系,提出其中的可变区域与不可变区域,并对可变区域与不可变区域的长度分布,可变区域在cds中出现的位置,由于选择性剪接引起的同一段序列读码框相位的变化以及可变区域与不可变区域及二者边界上的密码子使用频率进行了统计分析,得到了一些很有意思的结果.这些统计结果对于选择性剪接机制的进一步研究以及选择性剪接基因的预测提供了良好的线索.

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期刊信息
  • 《电子学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国电子学会
  • 主编:郝跃
  • 地址:北京165信箱
  • 邮编:100036
  • 邮箱:new@ejournal.org.cn
  • 电话:010-68279116 68285082
  • 国际标准刊号:ISSN:0372-2112
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2087/TN
  • 邮发代号:2-891
  • 获奖情况:
  • 2000年获国家期刊奖,2000年获国家自然科学基金志项基金支持,中国期刊方阵“双高”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:57611