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代谢网络流分析进展及应用
  • 期刊名称:科学通报
  • 时间:0
  • 页码:1302-1309
  • 语言:中文
  • 分类:Q756[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]上海交通大学生命科学技术学院,上海200240
  • 相关基金:国家自然科学基金(30800199,20773085,30770502)和国家高技术研究发展计划(2007AA022333)资助项目
  • 相关项目:细胞器代谢网络在内共生过程中的结构变化及适应性研究
中文摘要:

代谢网络的研究已经成为系统生物学研究的一个热门话题,基于代谢网络流分析的方法在寻求生物体代谢网络特征中具有很重要的作用.回顾了几种主要的代谢网络静态分析方法如:流平衡分析(FSA)、代谢调节最小化分析(MOMA)、调节的开关最小化(ROOM)、含有二次线性规划的动态流平衡分析方法(DFBA—LQR)等.另外,介绍了几种常用的代谢网络流分析软件,如Flux Analyzer,COBRA Toolbox,Pathway Analyser,并对这些软件的性能进行了比较.代谢网络的研究不仅能使人们更好地了解代谢网络性质,也在很多方面得到了应用,将代谢网络流分析和其他生化数据分析方法整合起来的理念逐渐形成并已有所进展,如代谢流与基因表达调控的结合、代谢流对蛋白质进化的影响、代谢流与拓扑特征的关联分析、代谢工程优化改造等.今后的研究方向可以将代谢流分析与网络拓扑特征分析以及动态建模等结合起来以获得更全面更准确的代谢网络性质.

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