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剑湖高原湿地茭草根系内生细菌多样性及其土壤影响因子研究
  • ISSN号:1672-8246
  • 期刊名称:《西部林业科学》
  • 时间:0
  • 分类:S154.3[农业科学—土壤学;农业科学—农业基础科学]
  • 作者机构:[1]西南林业大学,云南昆明650224, [2]云南省林业科学院,云南昆明650201
  • 相关基金:国家自然科学基金(U0933601),973项目(2010CB434807)和云南中青年科学技术项目(2010CI016),国家林业局西南风景园林工程技术研究中心资助.
中文摘要:

2011年在剑湖高原湿地3个入水口,1个出水口和湖面上分别采集茭草根系及对应土样,通过对样品DNA提取和PCR扩增,采用DGGE方法分析及内生细菌16SrDNA片段的克隆和测序,对剑湖茭草根系内生细菌多样性类群及种群影响因子进行研究。结果表明,剑湖不同取样地点的茭草根系内生细菌多样性不同,入水口金龙河的茭草根系内生细菌Shannon指数和Simpson指数最高,而出水口黑惠河的茭草根系内生细菌Shannon指数和Simpson指数最低;聚类分析显示所得细菌DGGE片段序列分为4个类群,分别为Firmicutes、Beta—proteobacteria、Gamma—proteobacteria和Unculturedbacterium;冗余分析显示,NH。’显著影响着茭草根系内生细菌的种群结构。

英文摘要:

Zizania caduciflora roots and soil sample were collected from water inlet, outlet and lake surface of Jian- hu plateau wetland respectively. The diversity and community structure of endophytic bacteria in Z. caduciflora roots were investigated by using denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) and 16S rDNA library methods. The results showed that the diversity of endophytic bacteria was different in each sampling location, the highest Shannon and Simpson index from the inlet-Jinlong River and the lowest from the outlet-Heihui River. The result of cluster analysis indicated that DGGE sequence was divided into four groups, they were Firmicutes, Beta- proteobacteria, Gamma-proteobacteria and Uncultured bacterium respectively. The result of Redundancy analysis (RDA) showed that NH4+ had an important impact on endophytic bacteria community.

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期刊信息
  • 《西部林业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:云南省林业厅
  • 主办单位:云南省林业科学院 云南省林学会
  • 主编:王卫斌
  • 地址:昆明市黑龙潭云南省林业科学院内
  • 邮编:650201
  • 邮箱:jwcfs@vip.163.com
  • 电话:0871-65151502
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-8246
  • 国内统一刊号:ISSN:53-1194/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 全国优秀期刊奖,云南省优秀期刊奖,改革创新奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版)
  • 被引量:4931