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Ⅰ型鸭肝炎病毒SH株全基因组序列测定与分析
  • ISSN号:1674-6422
  • 期刊名称:《中国动物传染病学报》
  • 时间:0
  • 分类:S852.659.6[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医] Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]中国农业科学院上海兽医研究所,上海200241
  • 相关基金:公益性行业(农业)专项经费(201003012); 中央级公益性科研院所基本科研业务专项经费(2010JB02)
中文摘要:

本研究从上海市某鸭场发病鸭群中分离到1株DHV-1型强毒株,对其进行毒价测定、琼脂扩散试验和动物回归实验,结果显示:按103.41 ELD50/0.2 mL接种1日龄雏鸭,该毒株对雏鸭有明显的致病性,死亡率为60%,肝脏病变率为100%。经全基因组测序显示:该毒株长度为7652 nt,含626 nt的5'非编码区和314 nt的3'非编码区,编码一个2249 aa大小的多聚蛋白。根据Blast比对发现,该毒株属于经典的DHV-1A群,与韩国经典强毒株R85952(99.7%)和中国分离强毒株HP-1(99.3%)的同源性最高。

英文摘要:

A virus isolate SH obtained from a duckling with liver ascites was confirmed as duck hepatitis virus type 1(DHV-1) by determination of virus titer,immunological detection and animal experiments.The virus caused 60% mortality and 100% liver lesions when inoculated into one day-old ducklings with 103.41 ELD50/0.2 mL.The virus genome was 7652 nucleotides long(not containing the poly(A) tail) consisting of 5'-and 3'-terminal non-coding regions of 626 and 314 nucleotides.The single open reading frame encoded a polypeptide of 2249 amino acids.Comparative genome analysis with other available strains in GenBank indicated that SH strain shared 99.3%~99.7% similarity at the nucleotide level with R85952 and HP-1 strains that were also isolated in China.

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期刊信息
  • 《中国动物传染病学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院上海兽医研究所
  • 主编:童光志
  • 地址:上海市闵行区紫月路518号
  • 邮编:200241
  • 邮箱:bianjibu@shrri.ac.cn
  • 电话:021-34293142
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-6422
  • 国内统一刊号:ISSN:31-2031/S
  • 邮发代号:4-748
  • 获奖情况:
  • 第二届全国畜牧兽医优秀期刊二等奖,首届《CAJ-CD规范》执行优秀奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:1517