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野生土坛树种群遗传多样性的SRAP分析
  • ISSN号:1004-874X
  • 期刊名称:广东农业科学
  • 时间:2015.10.3
  • 页码:127-132
  • 分类:Q346.5[生物学—遗传学]
  • 作者机构:[1]湛江市森林公园管理处,广东湛江524012, [2]广东海洋大学农学院,广东湛江524088, [3]湛江市农业科学研究院,广东湛江524094, [4]厦门大学环境与生态学院,广东厦门361102
  • 相关基金:国家自然科学基金(31170511)
  • 相关项目:雷州半岛木本植物区系变迁及其驱动力研究
中文摘要:

采用SRAP分子标记技术,对我国野生土坛树种群的遗传多样性进行分析。40对引物对8个土坛树种群共47个个体的样品DNA进行扩增。结果表明:物种水平上,多态位点百分率PPB为40.40%,Nei’s基因多样性指数H为0.4027,Shannon’s信息指数I为0.5874;在种群水平上,多态位点百分率平均为32.77%,Nei’s基因多样性指数平均为0.2992,Shannon’s信息指数平均为0.4373;种群内遗传多样性Hs为0.2992,种群总的遗传多样性Ht为0.4027。基因分化系数Gst为0.2570,种群间的遗传分化程度较低;种群间基因流Nm为1.4455。种群间的平均距离为0.2118。利用UPGMA法聚类可将8个群体划分为2大类,高桥独立为一群,其他为一大群;证明亲缘关系与地理距离存在一定的相关性。47个材料按UPGMA法聚类分析,结果不与同一种群的个体聚在一起。初步推测土坛树由三墩和琼山一带向四周扩散而来。

英文摘要:

The SRAP markers technology was used to analyze the genetic diversity of wild Alangium salviifolium populations in this paper.DNA samples of 47 individuals in eight A.salviifolium populations were amplied by 40 primers.Analysis showed that PPB(percentage of polymorphic loci) was 40.40%,H(Nei's genetic diversity) was 0.4027,I(Shannon's information index) was 0.5874 at the species level;PPB was 32.77%,H was 0.2992,I was 0.4373 at the population level;Hs was 0.2992,Ht was 0.4027;Gst(Genetic differentiation coefficient) was 0.2570,indicating that the degree of genetic differentiation was low.The gene flow among the populations was 1.4455 and the mean pair-wise genetic distance was 0.2118.The eight groups could be divided into two broad categories by UPGMA method.Gaoqiao group was independence category,and others joined as one category.It proved that there was certainly relationship between their kinships and geographical distances.According to UPGMA clustering analysis,47 materials did not join together in the same category with individuals of their own population.Preliminary results indicated that A.salviifolium spreaded from Sandun and Qiongshan to the surrounding areas.

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期刊信息
  • 《广东农业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广东省农业科学院
  • 主办单位:广东省农业科学院 华南农业大学
  • 主编:
  • 地址:广州市天河区金颖路31号五山广东省农科院农经所
  • 邮编:510640
  • 邮箱:gdnykx@vip.163.com
  • 电话:020-38319948 38319941 38319942 38319946
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-874X
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1267/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 广东省第二、第三届优秀科技期刊,广东省首届十佳期刊,中国期刊方阵“双效”期刊,第四届全国农业优秀期刊一等奖,第五届全车优秀农业期刊鑫犁奖一等奖,首届全国CAD规范一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国动物学记录,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版)
  • 被引量:33995