位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
裂殖壶菌EST文库cdc2基因的筛选与分析
  • ISSN号:1005-7021
  • 期刊名称:《微生物学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:Q93-3[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]福建师范大学工业微生物教育部工程研究中心,福建福州350108
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30370028);福建省科技厅重大资助项目(2003F005);福建省发改委资助项目([2005]847).
中文摘要:

利用已建立的裂殖壶菌(Schizochytrium sp FJU-512)EST文库,通过序列比对分析发现p34ede2相似基因的3’端序列,分离含该EST序列的质粒ROCHA2004,以T7物进行反向测序,获得p34cdc2相似基因的全长序列,结合NCBI的ORFfinder以及Blastx程序获得p34cdc2蛋白的氨基酸序列;利用同源模建方法构建了该蛋白的三维空间结构,并预测其功能结构域;对该蛋白进行系统发育分析,构建进化树,结果显示该蛋白同小麦(Triticum aestivum)的p34ede2序列亲缘关系最近。

英文摘要:

The 3 ' sequence of p34cdc2 similar gene was found through sequence comparison analysis using established EST library of Schizochytrium sp. FJU-512, and obtained complete sequence of the p34cdc2 similar gene by separating plasmid ROCHA2004 of the EST sequence, and carrying out reverse sequencing taking T7 as primer. And amino acid sequence of p34cdc2 protein was obtained by combining ORF finder and Blastx program from NCBI. Three dimensions structure of the protein was constructed using SWISS-MODEL method and prognosticated its functional structure domains. The results of phylogenetic analysis of the protein and the construction of pedigree indicated that the consanguinity of the protein was very close to p34cdc2 sequence of wheat ( Triticum aestivurn).

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《微生物学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:辽宁省科学技术委员会
  • 主办单位:中国微生物学会 辽宁省微生物学会 辽宁省微生物科学研究院
  • 主编:张忠泽
  • 地址:辽宁省朝阳市双塔区龙山街四段820号
  • 邮编:122000
  • 邮箱:lnwswxh@126.com
  • 电话:0421-2914613 2976840
  • 国际标准刊号:ISSN:1005-7021
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1186/Q
  • 邮发代号:8-142
  • 获奖情况:
  • 中国科技核心期刊,中国生物学核心期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊
  • 被引量:11311