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c-di-GMP抑制转录调控因子Clpxoo与葡聚糖酶基因启动子的结合
  • ISSN号:0001-6209
  • 期刊名称:微生物学报
  • 时间:2013.11.4
  • 页码:1166-1171
  • 分类:Q933[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]中国农业科学院植物保护研究所,植物病虫害生物学国家重点实验室,北京100193
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31100947),国家“973项目”(2011CBl00701)
  • 相关项目:水稻白叶枯病菌转录调控因子Clp对III型分泌系统表达的调控作用研究
中文摘要:

【目的】阐明水稻白叶枯病菌(Xanthomonasoryzaepv.oryzae,Xoo)c—di-GMP信号受体和转录调控因子Clpxoo对葡聚糖酶基因(engAxoo)的转录调控作用机制。【方法】通过基因表达载体的构建和转化、蛋白诱导表达及其Ni.NTAResin亲和层析,进行了c加zoo基因的原核表达和产物纯化。通过荧光素(FAM)探针标记和凝胶阻滞试验(EMSA)对Clpxoo纯化蛋白与葡聚糖酶基因启动子(engAxoo-p)的结合活性及其c—di—GMP信号分子的抑制作用进行了测定分析。【结果】在优化的诱导表达和纯化条件下,成功地获得了Clpxoo纯化蛋白。Clpxoo可与engAxoo-p序列发生阻滞现象,表明它具有与启动子特异性结合的活性。在反应体系中加入c—di—GMP可导致结合作用的消除。【结论】Clpxoo接受c—di-GMP信号后,可能通过构象的改变,从而与en鲋xoo-p的结合活性受到抑制;优化的Clpxoo蛋白纯化和EMSA方法可以用于后续的调控元大规模鉴定的研究。

英文摘要:

[ Objective ] To understand the regulatory mechanism by cyclic diguanylate (c-di-GMP) receptor and transcriptional regulator Clpxoo ofexpression of endoglucanase gene (engAxoo) in Xanthomonas oryzae pv. oryzae, the bacterial leaf blight pathogen of rice. [ Methods] A plasmid to expressclpxoo gene was constructed and transformed into Escherichia coli for expression by isopropylthio-13-D-galactoside (IPTG) induction. The recombinant protein was purified by Ni-NTA resin. The binding affinity between purified Clpxoo protein and the promoter of endoglucanase gene (engAxoo- p) was determined by electrophoretic mobility shift assay using fluoresce in (FAM) -labeled probes. The role of c-di-GMP on the binding was also examined. [ Results ] Under the optimized conditions, Clpxoo was expressed and purified successfully. Mobility shift of engAxoo-p in the presence of Clpxoo was observed, indicating that specific binding occurred between them. Moreover, addition of c-di-GMP molecules in the above reaction system abolished such binding. [ Conclusion ] Once interacting with the signal molecule c-di-GMP, Clpxoo conformational structure may change substantially, which results in inhibition of binding to engAxoo-p; The optimized methods for Clpxoo protein purification and electrophoretic mobility shift assay (EMSA) can be used for subsequent identification of Clp regulon in a larger scale.

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期刊信息
  • 《微生物学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国微生物学会 中国科学院微生物研究所
  • 主编:谭华荣
  • 地址:北京市朝阳区北辰西路3号中国科学院微生物研究所B401室
  • 邮编:100101
  • 邮箱:actamicro@sun.im.ac.cn
  • 电话:010-64807516
  • 国际标准刊号:ISSN:0001-6209
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1995/Q
  • 邮发代号:2-504
  • 获奖情况:
  • 国家优秀期刊二等奖,中科院优秀期刊二等奖,中国科协首届优秀科技期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:21879