新型农村合作医疗制度运行的好坏取决于一系列相关因素,其中筹资因素是关键因素之一,基于新疆新农合筹资问题,通过分析财政收支影响、地区经济发展水平影响、农牧民可支配收入与医疗设备等探讨影响筹资的主要因素,得出完善新疆新农合筹资要从补偿模式差异化、加大医疗设备与专业培训支出和筹资渠道应多元化等入手。