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彩色獭兔为典型的皮用兔,除具有獭兔的短、平、密、细、美、牢的优良毛皮品质外,其色泽艳丽,无需染色,环保自然,很受市场欢迎。本研究首先以海狸色、青紫蓝色、紫貂色、蓝色、黄色和黑色獭兔为研究对象,利用RFLP-PCR对agouti和Mc1r基因多态性进行分析,并使用采用邻接法和最大似然法分别以哺乳动物、啮齿类和兔类Mc1r基因序列构建分子进化树。E位点的Mc1r基因在彩色獭兔共发现两个等位基因A和B,A/-包括了海狸色、青紫蓝色、白色、紫貂色、黑色和宝石蓝色獭兔,隐性纯合基因型BB仅包括黄色獭兔,由于缺失30 bp的碱基序列（c.304333del30）造成的;黄色、黑色、蓝色獭兔在332（G>A）和510（C>T）发生无义突变。Mc1r基因单一位点发生突变能改变被毛颜色。进化分析显示,彩色獭兔Mc1r基因的分类学地位与在传统的形态学和生化特征分类的进化地位基本一致,说明Mc1r在进化过程中分子改变和功能性质之间的联系,在理解动物的自然适应性方面提供了有用的线索。