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骆驼瘤胃内降解含氮杂环化合物细菌的多样性
  • ISSN号:0001-6209
  • 期刊名称:《微生物学报》
  • 时间:0
  • 分类:S432.42[农业科学—植物病理学;农业科学—农业昆虫与害虫防治;农业科学—植物保护]
  • 作者机构:[1]新疆师范大学生命科学学院,新疆特殊环境物种保护与调控生物学实验室,干旱区植物逆境生物学实验室,新疆乌鲁木齐830054, [2]乌鲁木齐市职业中等专业学校,新疆乌鲁木齐830001, [3]成都医学院检验医学院,四川成都610500
  • 相关基金:国家自然科学基金(31160028);新疆师范大学博士科研启动基金(XJNUBS1607);新疆联合基金(U1503101);新疆维吾尔自治区自然科学基金(2016D018049)
中文摘要:

【目的】作为典型的荒漠动物,骆驼能够采食其他动物不能够食用的具有强烈气味的或有毒的植物,而不影响其正常生理代谢。研究发现骆驼采食的植物毒素与吡啶、喹啉、吲哚等杂环化合物具有相似的化学结构,所以研究骆驼体内是否存在潜在的杂环化合物降解菌具有重要意义。【方法】本研究采集3头骆驼瘤胃内容物,分别以吡啶、喹啉和吲哚3种含氮杂环化合物为唯一碳源和氮源进行5代富集培养。通过高通量测序技术对瘤胃内容物和5代富集培养细菌进行了测序分析。【结果】骆驼肠道中降解杂环化合物(吡啶、喹啉、吲哚)细菌群体样品中变形菌门、放线菌门、拟杆菌门、浮霉菌门和厚壁菌门等5个门类丰富度最高。骆驼瘤胃内降解吡啶的优势菌可能属于鞘氨醇杆菌属和不动杆菌属,降解吲哚的优势菌主要属于芽孢杆菌属,而降解喹啉的优势菌可能以赖氨酸芽孢杆菌属和鞘氨醇杆菌属为主。【结论】骆驼瘤胃原始样品经过吡啶、喹啉、吲哚富集5代后,与原始样品比较优势菌群发生了较大的改变,这说明骆驼瘤胃内蕴含降解吡啶、吲哚和喹啉的细菌,但对吡啶、吲哚和喹啉的降解过程中发挥降解作用的细菌群落存在差异。

英文摘要:

[Objective] As a typical desert animal, camel can eat pungent poisonous plants that are not eaten by other animals, and without affecting their normal physiological metabolism. Many studies found that phytotoxic substances in plants eaten by camel have similar chemical structure to that of pyridine, quinolone, indole and other heterocyclic compounds. However, few studies explored the biodiversity of bacteria degrading potentially heterocyclic compounds in camel rumen. [Methods] We used pyridine, quinolone and indole as the only carbon and nitrogen resources, and five generations of enrichment culture method to cultivate camel rumen bacteria, and used high throughput sequencing (Illumina Miseq) to sequence the total DNA of the five generations culture broth. [Results] Proteobacteria, Actinobacteria, Bacteroidetes, Planctomycetes and Firmicutes constitute the highest abundance of five categories of camel rumen bacteria degrading heterocyclic compounds. The dominant bacteria of degrading pyridine, quinolone, indole may belong to Sphingobacterium and Acinetobacter, Bacillus, Lysinibacillus and Sphingobacterium. [Conclusion] Camel rumen has heterocyclic compounds degrading bacteria.

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期刊信息
  • 《微生物学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国微生物学会 中国科学院微生物研究所
  • 主编:谭华荣
  • 地址:北京市朝阳区北辰西路3号中国科学院微生物研究所B401室
  • 邮编:100101
  • 邮箱:actamicro@sun.im.ac.cn
  • 电话:010-64807516
  • 国际标准刊号:ISSN:0001-6209
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1995/Q
  • 邮发代号:2-504
  • 获奖情况:
  • 国家优秀期刊二等奖,中科院优秀期刊二等奖,中国科协首届优秀科技期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:21879