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牛樟芝萜烯合成酶基因的克隆与鉴定
  • ISSN号:1000-4025
  • 期刊名称:《西北植物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q785[生物学—分子生物学] Q786[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]云南省林业科学院、国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室、云南省森林植物培育与开发利用重点实验室,昆明650204, [2]西南林业大学林学院,昆明650224
  • 相关基金:云南省科技厅对外科技合作计划(2015IA004); 国家自然科学基金(31400488); 云南省应用基础研究项目(2016FB055)
中文摘要:

为了研究牛樟芝(Antrodia camphorata)倍半萜的生物合成,通过对牛樟芝基因组分析获得倍半萜类合成酶基因(AcTPS2),利用RT-PCR克隆获得其全长cDNA,对其进行生物信息学分析和表达谱分析。结果显示:AcTPS2基因cDNA全长1 068bp,Blast比对发现,AcTPS2含倍半萜类合成酶所独具的富含天冬氨酸序列DXXXD及萜类合成酶特有的RRDTSG-LDL保守序列;系统进化分析显示,AcTPS2基因与其他真菌的倍半萜聚为一类;表达谱分析显示,以甘露糖作为碳源、以酪蛋白胨作为氮源能够有效促进AcTPS2基因的诱导表达。研究结果可为以后牛樟芝倍半萜类生物合成提供一定的参考依据。

英文摘要:

In order to study the biosynthesis of sesquiterpene,this text analyzed the sesquiterpene synthetases gene(AcTPS2)through genome analysis of Antrodia camphorata,and obtained the full length cDNA with RT-PCR,carried on bioinformatics and mRNA analysis.The results showed that AcTPS2 cDNA has1 086bp;Blast analysis revealed that AcTPS2 included abundant asparagic acid motif DXXXD that is specific motif of sesquiterpene synthetase,and terpene synthetase special conserved sequence RRDTSG-LDL;phylogenetic trees showed AcTPS2 and other fungus sesquiterpene synthetase amino acid sequence clustered in one clade;mRNA analysis showed manitol as carbon source,casein peptone as nitrogen source could promote AcTPS2 effectively,and the results could supply some basis in sesquiterpene biosynthesis.

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期刊信息
  • 《西北植物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学 陕西省植物学会
  • 主编:赵忠
  • 地址:陕西杨陵邰城路3号西北农林科技大学
  • 邮编:712100
  • 邮箱:xbzwxb@vip.163.com
  • 电话:029-87082936
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-4025
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1091/Q
  • 邮发代号:52-73
  • 获奖情况:
  • 全国优秀期刊,中国自然科学核心期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:46104