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应用基因表达芯片筛选大骨节病软骨差异表达的基因和基因通路
  • ISSN号:2095-4255
  • 期刊名称:《中华地方病学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R684[医药卫生—骨科学;医药卫生—临床医学;医药卫生—外科学]
  • 作者机构:西安交通大学环境与疾病相关基因教育部重点实验室与卫生部微量元素与地方病重点实验室,陕西西安710061
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(No.81102086)
中文摘要:

目的当前在骨关节疾病研究领域缺乏系统的跨组学研究,现就骨质疏松症全基因组多组学整合分析作一介评。方法该研究利用两个Meta分析的全基因组关联研究(GWAS)数据集,通过DMS算法在人类蛋白质互作网络(PPI)搜索得到影响骨密度的基因模块,然后使用基因表达谱数据对基因模块与疾病相关性进行评价。结果研究发现42个与股骨颈骨密度相关的基因模块和129个与腰椎骨密度相关的基因模块。利用基因表达谱评价候选基因模块与骨密度的相关性,最终得到两个显著相关的基因模块,功能涉及Wnt受体信号转导和成骨细胞分化。结论该研究发现的基因模块在骨量的调节中发挥着重要作用,为阐明骨质疏松症的发病机制提供了重要线索。

英文摘要:

Objective To review the integrative analysis of osteoporosis genome-wide with multi-omics data.Methods Data collected from two Meta-analyses regarding GWAS were analyzed and DMS calculations were used to find out the gene modules influencing bone mineral density on human protein-protein interactions networks.The gene modules and diseases relativity were reviewed.Results A total of 42 gene modules were found to be related to femoral and neck bone mineral densities and129 gene modules related to bone mineral density of lumbar vertebra.The relativity between gene modules and bone mineral density were strongly related to each other,including functions such as receptor signal transduction and osteoblast differentiation.Conclusion The gene modules discovered in this study play important roles in bone mass adjustments,providing theoretic clues to fully explain the pathogenesis of osteoporosis.

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期刊信息
  • 《中华地方病学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国卫生部
  • 主办单位:中华医学会 哈尔滨医科大学
  • 主编:
  • 地址:哈尔滨市南岗区保健路157号
  • 邮编:150081
  • 邮箱:cje2005@163.com
  • 电话:0451-86675924
  • 国际标准刊号:ISSN:2095-4255
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1583/R
  • 邮发代号:14-30
  • 获奖情况:
  • 2000年获黑龙江优秀科技期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,荷兰医学文摘,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:1230