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古菌蛋白质SSO6904的双体形式的NMR鉴定
  • ISSN号:1000-4556
  • 期刊名称:《波谱学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:O482.53[理学—固体物理;理学—物理] Q71[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]中国科学院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室,北京100101, [2]清华大学生命科学学院 生物信息学教育部重点实验室,北京100084, [3]中国科学院青岛生物能源与过程研究所,山东青岛266101
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金资助项目(30270301,30770434).
中文摘要:

古菌蛋白质SS06904是最近发现的一个全螺旋结构的、具有弱的钙离子结合活性的蛋白质.在蛋白质纯化过程中,通过凝胶过滤层析发现SS06904具有稳定的单体和双体形式.1HNMR谱表明2种形式的核心结构类似.2D 2H-15NHSQC谱表明单体和双体的结构差异主要处在连接螺旋2和3以及5和6的2个Loop链接区域,这2个Loop链接区域是形成双体的关键区域,而其他区域具有相同的结构.通过结构分析推测并搭建了一种结构域交换的SS06904双体结构模型.这种稳定的双体形式可能是调节SS06904功能的一种方式.

英文摘要:

Archaeal protein SSO6904 is a newly-discovered protein with weak calcium binding activity. Protein SSO6904 is an all-helices protein. Protein purification by gel filtration discovered both monomer and dimer forms of SSO6904. 1H NMR spectra indicated that the monomer and dimer have similar structural core. Analysis of 2D 1H-15N HSQC spectra revealed that the major structural difference between the monomer and dimer was at the two loops connecting helices 2 and 3, and helices 5 and 6, respectively. These two loops form a key structural region for constructing the dimer, while other regions of monomer and dimer have the same structures. Structural analysis proposed a domain-swapped model of the SSO6904 dimer. The domain-swapped dimer may regulate the stability and function of SSO6904.

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期刊信息
  • 《波谱学杂志》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院武汉物理与数学研究所 中国物理学会波谱学专业委员会
  • 主编:刘买利
  • 地址:湖北省武汉市武昌小洪山西区30号
  • 邮编:430071
  • 邮箱:magres@wipm.ac.cn
  • 电话:027-87198791
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-4556
  • 国内统一刊号:ISSN:42-1180/O4
  • 邮发代号:38-313
  • 获奖情况:
  • 1992 年获国家科委、中宣部、新闻出版署首届优秀...,获中国科1996年获中国科学院优秀期刊三等奖,1999年获第三届湖北省优秀期刊奖 ,并被列为湖北...,2001年获第四届湖北省优秀期刊奖,2006年获第五届湖北省优秀期刊奖,2008年获第六届湖北省优秀期刊奖,2010年获第七届湖北省优秀期刊奖---湖北省专业技...,2013年获第八届湖北省优秀期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:2740