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茶树赤霉素受体基因CsGID1a的克隆与表达分析
  • ISSN号:0496-3490
  • 期刊名称:作物学报
  • 时间:2013.4.12
  • 页码:599-608
  • 分类:S828[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]中国农业科学院茶叶研究所/国家茶树改良中心,浙江杭州310008, [2]中国农业科学院研究生院,北京100081, [3]西北农林科技大学园艺学院,陕西杨凌712100
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31170650); 浙江省自然科学基金重点项目(Z3100473); 国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-23)资助
  • 相关项目:基于转录组学的茶树冷驯化诱导抗寒性的分子机制研究
中文摘要:

GID1作为赤霉素信号转导的受体,在赤霉素作用中具有重要作用。采用同源克隆方法,利用RT-PCR和RACE技术在茶树中克隆到赤霉素受体基因GID1的cDNA全长,命名为CsGID1a(GenBank登录号为JX235369)。该基因全长1411bp,开放阅读框1023bp,编码341个氨基酸。生物信息学分析显示,CsGID1a编码的蛋白分子量为38.53kD,理论等电点为5.62;无信号肽位点,是非分泌性蛋白,具有1个跨膜区,基因被定位于细胞核内;CsGID1a氨基酸序列具有激素敏感性脂肪酶(HSL)家族蛋白的HGG、GXSXG功能域以及羧酸酯酶典型的三级结构;与其他物种的GID1相似性均在60%以上,与葡萄的相似性最大达87%、进化关系最近。荧光定量PCR结果显示,高浓度(1.0×10-5molL-1)GA3能够下调CsGID1a的表达,5h内的表达呈下降趋势;随着越冬茶芽萌动进程,CsGID1a表达量逐渐降低,特别在3月初萌发以后变化较大,推测赤霉素及其受体基因可能与茶树越冬芽解休眠相关。

英文摘要:

GIDI (Gibberellin insensitive dwarfl), as the soluble gibberellin (GA) receptor in GA signaling pathway, plays the vital role in GA reactions. In this study, the homologous gene of GID1 was isolated with RT-PCR and RACE-PCR from tea plant (Ca- mellia sinensis). The obtained cDNA sequence, named CsGIDla, had the full-length of 1411 bp containing a 1023 bp open read- ing frame (ORF), encoding 341 amino acid residues, and was submitted to GenBank with accession number JX235369. The bio- informatics characterization indicated that CsGIDla was a non-secretory protein without a signal peptide. The molecular weight and theoretic isoelectric point of CsGIDla are 38.53 kD and 5.62, respectively. CsGIDla was located in the nucleus, encoding a protein with one transmembrane domain. CsG1Dla contained hormone sensitive lipsase family (HSL) conserved domains, HGG and GXSXG motif, and shared the plant carboxylesterase tertiary structure. Homologous alignment and phylogenetic tree showed that CsGID 1 a shared over 60% amino acid sequence similarity with that of other species, and had the highest similarity (87%) and the closest genetic relationship to Vitis vinifera. The real-time PCR analysis showed that the expression of CsGIDla was down-regulated by high concentration of GA3 (1.0~ 10-5 tool L-1) and reduced slowly during the treatment for five hours. The further experiments suggested that the expression of CsGIDla was also decreased in the process of bud sprouting. These results demonstrated that CsGIDla and GA could be associated with bud bursting in tea plant in spring.

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期刊信息
  • 《作物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国作物学会 中国农业科学院作物科学研究所
  • 主编:万建民
  • 地址:北京海淀区中关村南大街12号中国农业科学院
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zwxb301@caas.cn
  • 电话:010-82108548
  • 国际标准刊号:ISSN:0496-3490
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1809/S
  • 邮发代号:82-336
  • 获奖情况:
  • 2002年-第三届中国科协优秀科技期刊二等奖,2002-2009年-百种中国杰出学术期刊,2004年获“全国优秀期刊一等奖”,2005年获第三届国家期刊奖提名奖,2009年评为“2008年度中国精品科技期刊”,2009年被评为“新中国60年有影响力的期刊”,2011年获"第二届中国出版政府奖期刊奖提名奖"
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:49369