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胚胎附植期梅山猪EphrinA1全编码区克隆及生物信息学分析
  • ISSN号:1000-4440
  • 期刊名称:江苏农业学报
  • 时间:2015
  • 页码:350-356
  • 分类:S852.651[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]南京农业大学动物科技学院,江苏南京210095, [2]江苏省农业科学院畜牧研究所/动物品种改良和繁育重点实验室,江苏南京210014
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31201767); 江苏省农业科技自主创新基金项目[CX(13)5042]; 国家生猪现代产业技术体系南京综合试验站项目(nycytx-009); 江苏省科技支撑计划项目(BE2012333)
  • 相关项目:梅山猪胚胎附植调控中Eph-Ephrin A1的功能和信号通路分析
中文摘要:

为了研究促红细胞生成素产生肝细胞配体A1(Ephrin A1)对梅山猪胚胎附植期胚胎在子宫内膜间迁移和对子宫内膜黏附活动的影响,利用克隆测序、生物信息学和qRT-PCR方法,克隆了Ephrin A1基因的全长编码序列,对其表达的蛋白结构和功能进行了预测,并检测了其mRNA表达变化。梅山猪Ephrin A1基因编码区有5个c SNPs变异,其中2个导致氨基酸突变,分别为Glu29Asn和Trp33Arg,位于Ephrin A1外显子1和外显子2上。Ephrin A1编码序列中含5个外显子,编码205个氨基酸。Ephrin A1为不稳定的亲水性蛋白,有1个信号肽和一个保守区域,无跨膜区。另外,Ephrin A1在梅山猪胚胎附植期有较强的mRNA表达。表明Ephrin A1基因可能参与梅山猪的胚胎附植调控,其c SNPs有望成为影响猪产仔数基因的潜在分子标记。

英文摘要:

In order to analyze the role of EphrinA1 in the migration and adhesion of embryo along the endometrium during embryo implantation in Meishan swine, EphrirtA1 coding sequence was cloned, protein structure and function were predicted and mRNA expression was detected by cloning, sequencing, bioinformatics and qRT-PCR method. Five cSNPs in EphrinA1 coding sequence were detected, two of which caused two amino acids changes which were Glu29Asn in exon 1 and Trp33Arg in exon 2. EphrinA1 coding se- quence contains five exons and encods 205 amino acids. Protein EphrinA1 is hydrophilic and instable, and has a signal peptide and a conservative region and no transmem- brane region. EphrinA1 mRNA showed a strong expression in Meishan swine during embryo implantation period. The results suggested that EphrinA1 might play a role in the regulation of embryo implantation in Meishan swine, and the cSNP is a potential molecular marker affecting swine litter size.

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期刊信息
  • 《江苏农业学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:江苏省农业科学院
  • 主办单位:江苏省农业科学院
  • 主编:严少华
  • 地址:南京市孝陵卫省农科院经信所
  • 邮编:210014
  • 邮箱:jsnyxb@163.com
  • 电话:025-84390285
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-4440
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1213/S
  • 邮发代号:28-113
  • 获奖情况:
  • 全国优秀科技期刊,江苏省优秀科技期刊,中国中文核心期刊,中国期刊方阵“双效”期刊,2008年获“江苏省质量评估”一级期刊20069年获...
  • 国内外数据库收录:
  • 英国农业与生物科学研究中心文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:15981