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多重相关检验中错误发现率的控制算法
  • ISSN号:1001-9081
  • 期刊名称:《计算机应用》
  • 时间:0
  • 分类:TP391.9[自动化与计算机技术—计算机应用技术;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构:华东交通大学信息工程学院,江西南昌330013
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(71361009)
作者: 刘遵雄, 陈昊
中文摘要:

假设检验问题是通过比较p值和置信水平α的值来决定是否拒绝对应的假设,p〈α时我们拒绝原假设。随着试验次数的增加,在所有满足零假设为真的p值集合中,数值较小的p值存在的可能性会增加,从而使得做出错误的判断,p值调整算法可以针对多重检验有效地缓解这类问题。本文讨论多重检验的p值调整算法的功效,模拟基因序列进行多重检验分析,产生2000个模拟量(即基因数量),重复实验1000次,得到1000组p值。对每组p值使用相应的调整算法得到新的p值,比较每个算法功效的优劣。模拟结果显示在我们所选用的5种p值调整算法中,q值方法(Storey 2003)能很好地控制错误发现率(FDR)的大小,同时具有更高的功效值。

英文摘要:

Hypothesis testing problem determines whether to reject the corresponding hypothesis through comparing p values with confidence level. A smaller p-value than the α-level of the test signifies a statistically significant test. As the number of tests increases, the chance of observing some small p-values is very high even when all null hypotheses are true. Consequently, we make wrong conclusions on the hypotheses. Adjustment of p-values can effectively alleviate this problem. A simulation study with several methods was carried out in multiple hypothesis testing. Simulations generate 2000 analogue. The experiment was repeated 1000 times, 1000 sets of p value are obtained. Use the adjustment methods to access the new p-value, and then compare the advantages and disadvantages of each algorithm. The correlation between genes expression is in the covariance matrix. Simulation results show that among five algorithms selected, q value method can be efficient to control the false discovery rate size, also with higher power.

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期刊信息
  • 《计算机应用》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:四川省科学技术协会
  • 主办单位:四川省计算机学会中国科学院成都分院
  • 主编:张景中
  • 地址:成都市人民南路四段九号科分院计算所
  • 邮编:610041
  • 邮箱:xzh@joca.cn
  • 电话:028-85224283
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-9081
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1307/TP
  • 邮发代号:62-110
  • 获奖情况:
  • 全国优秀科技期刊一等奖,国家期刊奖提名奖,中国期刊方阵双奖期刊,中文核心期刊,中国科技核心期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:53679