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桑树低温诱导基因Wap25的序列分析及表达产物的亚细胞定位
  • ISSN号:0257-4799
  • 期刊名称:《蚕业科学》
  • 时间:0
  • 分类:S888.2[农业科学—特种经济动物饲养;农业科学—畜牧兽医] Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]苏州大学金螳螂建筑与城市环境学院,江苏苏州215123, [2]浙江大学动物科学学院,杭州310029
  • 相关基金:资助项目:国家自然科学基金项目(No.30671589),公益性行业(农业)科研专项(No.nyhyzx07-020).致谢本研究的亚细胞定位工作在中国科学院上海植物生理生态研究所米华玲研究室完成,巩子英博士对本工作进行了悉心指导和热忱帮助,谨此致谢.
中文摘要:

Wap25是从桑树幼茎克隆的低温诱导蛋白基因,为胚胎后期富集蛋白(LEA)基因的成员之一,与其它物种低温诱导基因的同源性很低。生物信息学分析表明,桑树低温诱导基因Wap25编码蛋白由226个氨基酸组成,分子质量25.3kD,等电点5.52;蛋白N端1—30位氨基酸表现出强烈的疏水性,其后是亲水性高的区域,平均亲水值达-1.020,而蛋白1—29位氨基酸为典型的真核生物蛋白质的信号肽序列,表明WAP25蛋白属于分泌型蛋白。用SubLocv1.0软件预测WAP25的亚细胞定位,将该蛋白定位于细胞质中。Tmpred软件预测WAP25不存在跨膜结构。构建Wap25与绿色荧光蛋白(GFP)的重组质粒,用基因枪法将其转入洋葱表皮细胞,在激光扫描共聚焦显微镜下发现GFP分散于洋葱表皮的细胞质中,而在细胞核未发现GFP的表达,此结果与wAP25的亚细胞定位预测结果相符。

英文摘要:

Wap25 gene, which belongs to the late embryogenesis .abundant (LEA) family, was cloned from young stem of mulberry. The alignment analysis showed that this gene had very low identities with cold-induced genes in other species. Bioinformatics analyses indicated that Wap25 encodes a 226 amino acid protein with a theoretical molecular mass of 25.3 kD and a pl of 5.52. Its N-terminal amino acids 1 to 30 have strong hydrophobicity. The following amino acids are highly hydrophilic, with an average hrdrophilicity score of -1. 020. The N-terminus contains a typical signal peptide of eukaryotic proteins with a putative cleavage site located after position 29, suggesting that WAP25 is a secreted protein. Subcellular localization prediction with SubLocv 1.0 program indicated that WAP25 was located in cytoplasm and prediction with Tmpred software revealed that WAP25 had no transmembrane domain. A green fluorescent protein (GFP) fusion recombinant protein expression vector was constructed and transformed into onion epidermal cells by biolistic meth- od. Observation under laser scanning confocal microscope showed that GFP was disseminated in the cytoplasm of onion epidermal cells and no signal was found in nucleus, being consistent with the predicted result of subcellular localization.

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期刊信息
  • 《蚕业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国蚕学会 中国农业科学院蚕业研究所
  • 主编:郭锡杰
  • 地址:江苏省镇江市四摆渡中国农业科学院蚕业研究所
  • 邮编:212018
  • 邮箱:CYKE@chinajournal.net.cn
  • 电话:0511-85616835
  • 国际标准刊号:ISSN:0257-4799
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1115/S
  • 邮发代号:28-23
  • 获奖情况:
  • 中国科协优秀科技期刊,全国农业学会优秀期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:7742