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华南地区猪流行性腹泻病毒的分离鉴定及其S基因抗原表位片段的遗传变异分析
  • ISSN号:0529-6005
  • 期刊名称:《中国兽医杂志》
  • 时间:0
  • 分类:S858.28[农业科学—临床兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]华南农业大学兽医学院广东省人畜共患病重点实验室,广东广州510642, [2]广东大华农动物保健品股份有限公司,广东新兴527400
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金(31072138)
中文摘要:

应用RT—PCR方法对华南地区某大型猪场疑似猪流行性腹泻病料检测,选取阳性病料接种到Veto细胞,命名为CH/GDGZ/2012(简称GD-12)株。用病毒RNA抽提物为模板,对GD-12的S基因抗原区片段的扩增、克隆后进行核苷酸测序。序列分析表明,CH/GDGZ/2012与CV777、Chinju99、Br1/87、DR13和SM98的核苷酸序列同源性分别为96.9%、93.0%、95.7%、96.7%和96。0%,氨基酸序列的同源性分别为97.7%、91.5%、95.4%、98.0%和94.8%。进化树分析结果显示,华南地区CH/GD-01/2011、CH/GDGZ/2012、GDHSY/2011、CH/GXQZ/2011毒株与经典毒株的遗传距离较大,处于不同的亚群。研究表明,PEDVGD-12株已发生遗传变异、关键抗原表位发生较大变化,该研究可为诊断和防控该病提供参考。

英文摘要:

Porcine epidemic diarrhea virus(PEDV)specific RT-PCR was used to detect tissue samples of diseased pigs in south China. Tissue samples of diseased pigs were inoculated in Vero cells and cultured to the third generation. The major antigenic epitope of S gene of the PEDV isolate was amplified cloned and sequenced. Sequence analysis showed that the S gene of CH/GDGZ/2012 strain was 96.9%,93.0%, 95.7%,96.7% and 96.0% identical at nucleotide sequence level and 97.7%,91.5%495.4%,98.0% and 94.8% identical at amino acid sequence level compared to that of strains CV777,Chinju99,Brl/87,DR13 and SM98, respectively. CH/GDGZ/2012 and CH/GD-01/2011,GDHSY/2011,CH/GXQZ/2011 belonged to the same subgroup based on phylogenetic tree established with nucleotide sequences of the S genes of PEDV strains. The results indicate that the genetic variability of the virus and major epitopes changed greatly. The study can provide a reference for the diagnosis and prevention and control of the disease.

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期刊信息
  • 《中国兽医杂志》
  • 北大核心期刊(2014版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国畜牧兽医学会
  • 主编:张克家
  • 地址:北京市海淀区圆明园西路2号
  • 邮编:100193
  • 邮箱:vetzzhi@cau.edu.cn
  • 电话:010-62733040
  • 国际标准刊号:ISSN:0529-6005
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2471/S
  • 邮发代号:2-137
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:19671