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抗黄曲霉毒素M1单链抗体基因克隆与蛋白结构模拟
  • ISSN号:0258-3283
  • 期刊名称:化学试剂
  • 时间:2012
  • 页码:963-966
  • 分类:Q51[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]中国农业科学院油料作物研究所,湖北武汉430062, [2]农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室,湖北武汉430062, [3]农业部生物毒素检测重点实验室,湖北武汉430062, [4]农业部油料产品质量安全风险评估实验室(武汉),湖北武汉430062, [5]农业部油料及制品质量监督检验测试中心,湖北武汉430062
  • 相关基金:农业部948项目(2010-G1,2011-G5);国家自然科学基金资助项目(31171702,31101299);国家农业行业科技专项资助项目(201203094,201203037);国家科技支撑计划资助项目(2012BAB19809,2012BAK08803);中国农业科学院油料作物研究所所长基金项目(1610172010003).
  • 相关项目:黄曲霉毒素分子工程抗体活性机制研究
中文摘要:

为构建抗黄曲霉毒素M1单链抗体(seFv)基因,并进行蛋白质结构模拟及理化特性分析。采用重叠延伸PCR方法,以能特异性分泌抗黄曲霉毒素M1单克隆抗体的杂交瘤细胞株1812为原料,构建其单链抗体基因,进行测序,采用生物信息软件进行氨基酸序列推导、结构预测以及理化性质分析。抗黄曲霉毒素M1seFv基因全长737bp,对应245个氨基酸,单链抗体分子量约为25897.4,等电点预测值6.90;二级结构显示抗黄曲霉毒素M。单链抗体含a螺旋38处,卢折叠24处,延伸链74处,随机卷曲109处。三级结构建模显示重链(VH)和轻链(VL)的6个环区(CDR区),共同组成抗体的抗原结合区,符合scFv的结构特点,具有抗原结合位点的空间构象。构建了一个抗黄曲霉毒素M1scFv基因,应用生物信息学技术所获得的预测和分析结果为该单链抗体的进一步表达、纯化和活性研究提供信息。

英文摘要:

To construct the gene of single chain Fv (scFv) fragment against aflatoxin M1 ,to predict secondary and tertia- ry structures of its encoding protein by computer assisted modeling and to analyze its physical and chemical properties. The gene of anti-afiatoxin M1 scFv was constructed with I B12 hybridoma cells that is able to secret monoclonal antibodies (mAb) with high activity and specificity against aflatoxin M1 as the raw material, and sequenced by splicing overlap exten- sion(SOE) PCR assay. Furthermore,its amino acid sequence was deduced and the secondary and tertiary structures were predicted using biological information software. Meanwhile, its physical and chemical properties were analyzed. The full- length scFv gene had 737 bp and encoded 245 amino acids. The relative molecular weight of the scFv was 25 897.4, its predictive isoelectric point(pl) was 6. 90. The predicted sec- ondary structure indicated that the protein contained 38 α-he- lix,24 β-sheet,74 extended strand and 109 random coli. The mimic tertiary structure model of the scFv indicted that all the six CDRs of VL and VH were contribute to the antlgen-bind- ing site. The successful construction of a scFv gene against af- latoxin M1 can laid the foundation for the further research into the expression, purification and bioactivity of genetic engi- neering antibody.

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期刊信息
  • 《化学试剂》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国石油和化学工业联合会
  • 主办单位:中国分析测试协会 国药集团化学试剂有限公司 北京国化精试咨询有限公司
  • 主编:何晖
  • 地址:北京市西城街太平街8号院6号楼2层107室
  • 邮编:100050
  • 邮箱:webmaster@chinareagent.com.cn
  • 电话:010-58321793
  • 国际标准刊号:ISSN:0258-3283
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2135/TQ
  • 邮发代号:2-444
  • 获奖情况:
  • 获全国首届优秀科技期刊评比三等奖,2001年入选“中国期刊方阵”被评为“双效”期刊,2002年在第五届全国石油和化工优秀期刊评选中获一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:12515