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果实软化相关PG基因的进化分析和基因组定位
  • ISSN号:0513-353X
  • 期刊名称:园艺学报
  • 时间:2011.9.9
  • 页码:1791-1799
  • 分类:S66[农业科学—果树学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]辽宁省果树科学研究所 国家果树种质熊岳李杏圃,辽宁熊岳115009
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31071767); 公益性行业(农业)科研专项(201003058)
  • 相关项目:杏果实硬度的关联分析与功能标记研究
中文摘要:

利用NCBI数据库和蔷薇科基因组数据库中的数据对48个果实PG基因进行系统进化分析,结果表明3个进化支中都包含与果实软化相关的PG基因,属于A支和属于B支的PG基因有明显的功能差异。氨基酸序列分析显示,3个进化支中的PG基因存在多个差异位点,A支和C支PG基因的N端比B支短60~70个氨基酸。PG基因结构(包括启动子、内含子和编码区)的变异对其功能差异有重要影响。对苹果和桃的PG基因进行了基因组精确定位,其附近存在果实软化相关性状标记。

英文摘要:

Forty-eight PG genes were classified into three major clades by phylogenetic analysis and each clade contained PG genes that involved in fruit softening.PG genes belonged to clade A and clade B had functional divergence obviously.There were some different amino acid sites in amino acid sequence of PG genes from different clades.PG genes in clade A and clade C had a deletion of 60-70 amino acids in N terminal end compared with PG genes in clade B.Variation in the structure of PG genes(mainly including promoter regions,introns and encoding regions)had a significant impact on their functions.PG genes in apple and peach were accurately localized in genome respectively and around the genes there were some fruit softening markers.

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期刊信息
  • 《园艺学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中国园艺学会
  • 主编:杜永臣
  • 地址:北京市中关村南大街12号
  • 邮编:100081
  • 邮箱:ivfyyxb@mail.caas.net.cn
  • 电话:010-68919523
  • 国际标准刊号:ISSN:0513-353X
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1924/S
  • 邮发代号:82-471
  • 获奖情况:
  • 第一届全国优秀期刊奖,中国科协第三届优秀期刊奖,第二届国家期刊奖提名奖,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:43371