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利用RNA指纹技术分析大白菜胞质雄性不育相关基因的差异表达
  • ISSN号:0253-9772
  • 期刊名称:《遗传》
  • 时间:0
  • 分类:S634.1[农业科学—蔬菜学;农业科学—园艺学] Q943[生物学—植物学]
  • 作者机构:[1]西北农林科技大学园艺学院,杨凌712100
  • 相关基金:国家自然科学基金(编号:30270913)资助
中文摘要:

采用改进的RNA指纹技术(RAP—PCR)对两套大白菜胞质雄性不育材料及其杂种F1花蕾的总RNA进行了分析,通过对186条随机引物的筛选,获得4个重复性较好的差异片段S47—412,S93—622,S176—343,S199—904,并对其克隆、测序。根据各差异条带的测序结果合成长引物进行验证,S47,S93所对应的差异消失,而S176,S199长引物验证的结果与RAP—PCR相似,序列分析表明:S176—343,S199—904两差异片段均和油菜Polima不育胞质线粒体基因组orf224/atp6位点有着极高的同源性,两差异片段序列部分重叠,这说明两差异片段可能和大白菜胞质雄性不育有很高的相关性。

英文摘要:

In order to investigate the differential expression of the genes related to cytoplasmic male sterility in Chinese cabbage (Brassica campestris L. ssp. Penkinsis), a modified RNA fingerprinting technique was developed to compare the difference in the total RNA from flower bud of Chinese cabbage among cytoplasmic male sterility (CMS) lines, maintainer lines and F1 hybrids. Four stably differential fragments S47-412, S93-622, S176-343 and S199-904 were amplified, cloned and sequenced with primers selected from 186 random primers. Based on the nucleotide sequence of the four differential fragments, four pairs of specific primers were designed to validate the differential fragments. The validation showed S47-412 and S93-622 were false positives and S176-343 and S199-904 were confirmed by PCR with the specific primers. Sequence analysis revealed that both of two differential fragments had strong homology with the nucleotide sequence of orf224/atp6 site of Polima CMS and the nucleotide sequence of S176-343 and S199-904 had a superposed region. All these indicate that the two fragments probably have strong relationship with cytoplasmic male sterility in Chinese cabbage.

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期刊信息
  • 《遗传》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国遗传学会
  • 主编:张永清
  • 地址:北京朝阳区北辰西路1号院中国科学院遗传发育所
  • 邮编:100101
  • 邮箱:yczz@genetics.ac.cn
  • 电话:010-64807669
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-9772
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1913/R
  • 邮发代号:2-810
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,《CAJ-CD》执行优秀奖,2008年12月获“中国精品科技期刊”证书和北京市印...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:23270