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决明巴豆酰辅酶A羧化酶基因的克隆、序列分析以及组织差异表达
  • ISSN号:1001-0009
  • 期刊名称:《北方园艺》
  • 时间:0
  • 分类:S567.9[农业科学—中草药栽培;农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]西南交通大学生命科学与工程学院,四川成都610031
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(31371232)
中文摘要:

通过RACE克隆得到了决明MCCase的cDNA,利用生物信息学进行系统分析,并利用荧光定量PCR对决明MCCase进行了差异表达分析。结果表明:决明MCCase全长1 269bp,编码423个氨基酸的蛋白质,为偏酸性不稳定蛋白质,定位于线粒体或细胞质中。决明MCCase与拟南芥的MCCase同源性最高。MCCase上有一个保守的功能结构域,与乙酰CoA羧化酶显示出较高的相似性,并在该结构域内发现了4个高度保守的氨基酸基序,可能在催化过程中发挥关键作用。MCCase在不同组织中存在差异表达,在根与胚轴中显示出高表达,在其它组织中表达量低,这可能与光和糖类抑制MCCase的表达有关。

英文摘要:

The cDNA sequence of Cassia obtusifolia MCCase was abtained by RACE and analyzed by bioinformatics.The tissue-specific expression of MCCase was analyzed by quantitation RT-PCR.The results showed MCCase sequence had length of 1 269 bp and coded a protein consisting of 423 amine acids,which was an acid,hydrophilic,unstable protein and was located to mitochondria or cytoplasm.Cassia MCCase had the highest homology with Arabidopsis MCCase.There was a conserved functional domain in MCCase,which was similar to that of acetyl CoA carboxylase.Four highly conserved motifs were found in the conserved domain and might play important role in catalysis.MCCase expressed diferently in various tissues.It showed high expression level in root/hypocotyl and low expression level in other tissues.This might be related to the expressional inhibition of MCCase caused by carbohydrate and light.

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期刊信息
  • 《北方园艺》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:黑龙江省农科院
  • 主办单位:黑龙江省园艺学会 黑龙江省农业科学院
  • 主编:毕洪文
  • 地址:哈尔滨市南岗区学府路368号
  • 邮编:150086
  • 邮箱:bfyybjb@163.com
  • 电话:0451-86674276
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-0009
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1247/S
  • 邮发代号:14-150
  • 获奖情况:
  • 1996年获黑龙江省优秀期刊奖(二等),2000年获黑龙江省优秀期刊奖,2002年获全国优秀农业期刊奖,2005年获首届黑龙江省出版精品工程提名奖,2009年获中国北方优秀期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:36972