目前,城市群已经成为区域创新的重载体。本文以城市群为研究对象,在分析城市群区域44新体系顸层结构的基础上构建了我国城市群创新体系运行评价的“四三结构”模型;运用相对模糊偏差矩阵的方法,从创新投入、创新主体、创新内容和44新产出四个维度对城市群区域创新体系运行的现状和差异进行了分析,综合评价了城市群区域创新体系运行情况。研究表明,我国城市群区域创新体系运行状况可以分为4个层次,并在四维上均出现了同步非均衡现象。