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基于NMR自旋弛豫技术的蛋白质动力学研究
  • ISSN号:1000-4556
  • 期刊名称:《波谱学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:O482.53[理学—固体物理;理学—物理] Q51[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]中国科学院上海药物研究所生物核磁共振实验室,上海201203, [2]厦门大学化学化工学院化学生物学系结构生物学实验室,福建厦门361005
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金资助项目(30730026,30570352);上海市优秀学科带头人计划资助项目(09XD1405100).
中文摘要:

蛋白质的三维结构在很多情况下不能很好地解释其在生理过程中的作用机制.动力学研究能够获悉蛋白质在不同时间尺度下的内运动信息,建立起动态结构和生物功能的联系.该文综述了通过NMR自旋弛豫技术研究蛋白质动力学的原理和方法:ps~ns的快运动分析主要采用约化谱密度函数映射和Modelfree方法;us~ms的慢运动涉及化学/构象交换过程,常借助CPMG和R1ρ弛豫色散手段.基于NMR的蛋白质动力学研究,将蛋白质科学从三维空间结构推进到四维时空结构的新层面.

英文摘要:

A static three-dimensional structure alone does not fully interpret the physiological functions of a protein in many cases. Dynamics studies can disclose internal motions of a protein on different time scales, providing a better link between dynamic structures and biological functions. In this review, the theoretical and experimental methods for protein dynamics studied by NMR spin relaxation are summarized. The reduced spectral density mapping and the Modelfree formulism are employed to describe fast motions on the ps-ns time scale. Slow motions on the us-ms time scale, associated with conformational and chemical exchanges, are often analyzed by CPMG and R1ρ relaxation dispersion curves. NMR-based dynamics studies promote protein structures from the three-dimensional date to the four-dimensional era.

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期刊信息
  • 《波谱学杂志》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院武汉物理与数学研究所 中国物理学会波谱学专业委员会
  • 主编:刘买利
  • 地址:湖北省武汉市武昌小洪山西区30号
  • 邮编:430071
  • 邮箱:magres@wipm.ac.cn
  • 电话:027-87198791
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-4556
  • 国内统一刊号:ISSN:42-1180/O4
  • 邮发代号:38-313
  • 获奖情况:
  • 1992 年获国家科委、中宣部、新闻出版署首届优秀...,获中国科1996年获中国科学院优秀期刊三等奖,1999年获第三届湖北省优秀期刊奖 ,并被列为湖北...,2001年获第四届湖北省优秀期刊奖,2006年获第五届湖北省优秀期刊奖,2008年获第六届湖北省优秀期刊奖,2010年获第七届湖北省优秀期刊奖---湖北省专业技...,2013年获第八届湖北省优秀期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:2740