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miR-146b靶标预测及功能分析
  • ISSN号:0253-3685
  • 期刊名称:江苏医药
  • 时间:2013.2.15
  • 页码:266-268
  • 分类:R318[医药卫生—生物医学工程;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]南京医科大学第二附属医院内分泌病科,江苏省210011, [2]南京医科大学儿科研究所, [3]南京医科大学附属南京妇幼保健院
  • 相关基金:国家自然科学基金(81100619); 江苏省医学创新团队项目(LJ201108); 江苏省自然科学基金(BK2011107); 南京市科技发展计划(201104013)
  • 相关项目:miR-146b-5p调控脂肪细胞分化的机制研究
中文摘要:

目的通过对miR-146b进行系统的生物信息学分析,预测miR-146b的靶基因及其功能。方法应用miRBase获取并分析miR-146b的序列特征;应用TargetScan、PicTar及miRanda预测miR-146b的靶基因,进行功能注释和信号转导通路分析;应用PubMed、Google等信息搜索工具综述miR-146b已有功能研究。结果 miR-146b在各物种之间具有高度保守性。功能注释显示预测靶基因主要富集于促细胞增殖、转录调控、调控细胞分化等生物学过程。信号转导通路分析显示预测靶基因显著富集于白血病、ErbB信号通路、促分裂原活化的蛋白激酶通路等。结论生物信息学分析提示,miR-146b可能与细胞分化、代谢密切相关。

英文摘要:

Objective To predict the targets and functions of miR-146b by bioinformatic analysis.Methods The sequence of miR-146b was obtained by miRBase database.The targets of miR-146b were predicted by Target Scan,PicTar and miRanda and then were analyzed by gene ontology and pathway analysis.PubMed and Google were used to review previous studies of miR-146b.Results miR-146b was highly conserved among various species.Gene ontology analysis showed that these target genes were enriched in promoting cell proliferation,transcriptional control,regulation of cell differentiation and other biological processes.The pathway analysis revealed that the target genes mainly involved in leukemia,ErbB,mitogen-activated protein kinase and other signaling pathways.Conclusion Bioinformatic analysis indicates that miR-146b is closely related with cell differentiation.

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期刊信息
  • 《江苏医药》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:江苏省卫生厅
  • 主办单位:江苏省人民医院
  • 主编:
  • 地址:南京市广州路300号
  • 邮编:210029
  • 邮箱:yiya@chinajournal.net.cn
  • 电话:025-57711507 83216587
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-3685
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1221/R
  • 邮发代号:28-4
  • 获奖情况:
  • 中国科技论文统计源期刊,全国临床医学核心期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:32760