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异色瓢虫的HSP90基因的克隆与特性分析
  • ISSN号:0529-6579
  • 期刊名称:《中山大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]杭州师范大学杭州市动物适应与进化重点实验室,浙江杭州310036, [2]北京市农林科学院植保环保所,北京100089, [3]中山大学生命科学学院,广东广州510275
  • 相关基金:基金项目:国家“973”计划资助项目(2009CB119200);国家科技部支撑计划资助项目(2008BADA5802);杭州师范大学高层次人才引进启动基金资助项目(YS05203105)
中文摘要:

采用同源克隆和锚定PCR技术,从异色瓢虫Harmoniaaxyridis(Pallas)中克隆到热休克蛋白HSP90基因的eDNA全序列(Genbanknumber:FJ501962)。eDNA全长2480bp,包含3’非编码区域(UTR)为200bp和5’UTR为126bp,开放阅读框(ORF)长2154bp,编码717个氨基酸。预测的相对分子质量为82230,理论等电点为4.96,无糖基化位点、跨膜结构和信号肽。在N端具有HSP90基因保守的ATPase结构,含有HSP90家族的C末端的保守序列EEVD。与赤拟谷盗Triboliumcastaneurn相比较,同源性高达90%,系统发育分析也表明两者的亲缘关系最近。HaaHSP90基因的克隆和比较分析为进一步深入研究异色瓢虫的抗逆机理及其进化具有重要意义。

英文摘要:

The heat shock protein 90 (HSP90) gene from Harmon& axyridis (Pallas) was cloned using techniques of homological cloning and anchored PCR. The full length of cDNA sequence is 2 480 bp (Genbank number: FJ501962), containing a 3'UTR (untranslated region) of 200 bp, a 5'UTR of 126 bp, and an ORF of 2 154 bp which encodes a polypeptide of 717 amino acids with an estimated molecular weight of 82 230 and pl of 4.96. There are no glycosylation sites, putative transmembrane domain and signature peptide. It contains ATPase conservative domain of (HSP90) in N-site and EEVD signature sequence on C-site. Compared with Tribolium castaneum, they are 90% identities and Phylogenetic analysis shows that these two species are most closely related. Cloning and comparison analysis of HSP90 genes from Harmonia axyridis (Pallas) could be useful in the studies of anti-stress mechanism, tolerance improvement breeding and evolution for these animals.

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期刊信息
  • 《中山大学学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:国家教育部
  • 主办单位:中山大学
  • 主编:王建华
  • 地址:广州市新港西路135号
  • 邮编:510275
  • 邮箱:xuebaozr@mail.sysn.edu.cn
  • 电话:020-84111990
  • 国际标准刊号:ISSN:0529-6579
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1241/N
  • 邮发代号:46-15
  • 获奖情况:
  • 全国优秀高等学校自然科学学报及教育部优秀科技期...,广东省优秀科学技术期刊一等奖,《中文核心期刊要目总览》综合性科技类核心期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,德国数学文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:18509