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Sequence-related amplified polymorphism primer screening on Chinese fir(Cunninghamia lanceolata(Lamb.) Hook)
  • ISSN号:1007-662X
  • 期刊名称:《林业研究:英文版》
  • 时间:0
  • 分类:S565.4[农业科学—作物学] S791.248[农业科学—林木遗传育种;农业科学—林学]
  • 作者机构:[1]Guangdong Academy of Forestry, Guangzhou 510520,The People's Republic of China, [2]National Engineering Laboratory for Tree Breeding, BeijingForestry University, Beijing 100083, The People's Republicof China
  • 相关基金:supported by the National Natural Sciences Foundation of China (No. 31200506); the Special Fund for Forest Scientific Research in the Public Welfare (No. 201404127)
中文摘要:

中国冷杉木(Cunninghamia lanceolata (兰姆) 钩) 是在中国为木材生产使用的最重要的具球果的树种类之一。这里,我们进行了顺序相关的放大多型性(SRAP ) 有 594 教材联合的一个总数的教材屏蔽试金,用 22 在四代表性的中国人上提交, 27 逆行教材冷杉木遗传型。获得的结果显示中国冷杉木 genomic DNA 穿上著名扩大偏爱采用了前面或反向的教材核苷酸(3 个选择底) 。从测试教材集合,与清楚地著名的乐队一起的 35 教材联合,稳定的扩大,和富人,多型性被选择并且鉴别同样最佳的教材集合。这些最佳的教材对给了 379 个 scorable 乐队的一个总数,包括 265 个多态的乐队,与每教材联合的 10.8 个乐队和 7.6 个多态的乐队的一般水准。为每个最佳的教材集合的生产乐队数字与从 33.3 ~ 100.0 跨越的多态的乐队的一个百分比从 7 ~ 14 ?% 。这些教材联合能在中国冷杉木便于下一 SRAP 分析试金。

英文摘要:

Chinese fir(Cunninghamia lanceolata(Lamb.)Hook) is one of the most important coniferous tree species used for timber production in China. Here, we conducted a sequence-related amplified polymorphism(SRAP) primer screening assay with a total of 594 primer combinations,using 22 forward and 27 reverse primers on four representative Chinese fir genotypes. The obtained results indicated that Chinese fir genomic DNA has a notable amplification bias on the employed forward or reverse primer nucleotides(30selection bases). Out of the tested primer sets, 35 primer combinations with clearly distinguished bands, stable amplification, and rich polymorphism were selected and identified as optimal primer sets. These optimal primer pairs gave a total of 379 scorable bands,including 265 polymorphic bands, with an average of 10.8bands and 7.6 polymorphic bands per primer combination.The produced band number for each optimal primer set ranged from 7 to 14 with a percentage of polymorphic bands spanning from 33.3 to 100.0 %. These primer combinations could facilitate the next SRAP analysis assays in Chinese fir.

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期刊信息
  • 《林业研究:英文版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:教育部
  • 主办单位:东北林业大学
  • 主编:杨传平
  • 地址:哈尔滨市动力区和兴路26号
  • 邮编:150040
  • 邮箱:jfr@mail.nefu.edu.cn
  • 电话:0451-82191144 82190464
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-662X
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1409/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 1999年黑龙江省科技期刊审读评比农、林、水、医87...,2000年黑龙江省优秀科技期刊评比中获二等奖,省科技厅,2002年黑龙江省期刊语言文字规范检查评比获一等奖...,2002年《中国学术期刊(光盘版)检索与数据规范》...,2004年获得全国优秀农业期刊学术类二等奖,中国农学会,2008年获得第二届中国高校优秀期刊奖,教育部科技司,2008年荣获第六届中国科协期刊优秀学术论文二等奖...,2009年获教育部科技论文在线优秀期刊二等奖,
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,荷兰地学数据库,荷兰文摘与引文数据库,美国生物科学数据库,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊
  • 被引量:349