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β-乳球蛋白过敏原表位适配体的计算机辅助分子设计与筛选
  • ISSN号:1001-4160
  • 期刊名称:《计算机与应用化学》
  • 时间:0
  • 分类:TQ015.9[化学工程] TP391.9[自动化与计算机技术—计算机应用技术;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构:[1]安徽农业大学茶与食品科技学院, 安徽食品安全分析与检测省级实验室,安徽合肥230036, [2]山东省滕州市产品质量监督检验所,山东枣庄277500
  • 相关基金:安徽省自然科学基金项目(11040606M91).
中文摘要:

本研究以β-乳球蛋白为模板,针对不同过敏原表位,基于正义链和反义链互补的原则,利用计算机辅助分子设计筛选出与β-乳球蛋白过敏原表位很好结合的适配体。分子对接结果表明,适配体QWVW,RRSL,GWGLP,RDGY和WVDL与β-Lg对接的能量是几个主要的过敏原表位中较低的,其中适配体RRSL与β-乳球蛋白对接的能量为本次实验最低,为-107.292 kcal/mol。并通过对分子对接过程中氢键作用、静电作用、疏水作用的研究,证明设计筛选出的适配体可以特异性地与β-乳球蛋白过敏原表位结合,从而达到掩盖β-乳球蛋白过敏原表位的目的。

英文摘要:

In this research, β-lactoglobulin was chosen as the template, the targeting aptamers based on the sense and antisense strandcomplementary principle from different allergen epitopes can be designed. The targeting aptamers which can bind β-1actoglobulin specifically were screened through the computer simulation software of docking. The result shows that the aptamers QWVW, RRSL, GWGLP, RDGY and WVDL have the minimum energy of the various allergens sites docking with β-1actoglobulin, and the aptamer RRSL has the minimum energy in this research which is -107.292 kcal/mol. After the study of the hydrogen boding, electrostatic interaction, hydrophobic interaction on the molecular docking process, we can find the targeting aptamer which can bind β-lactoglobulin specifically. So it can achieve the purpose of elimination of β-1actoglobulin allergenic

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期刊信息
  • 《计算机与应用化学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院过程工程研究所
  • 主编:王基铭
  • 地址:北京中关村北二街1号
  • 邮编:100080
  • 邮箱:jshx@home.ipe.ac.cn
  • 电话:010-62558482
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-4160
  • 国内统一刊号:ISSN:11-3763/TP
  • 邮发代号:82-500
  • 获奖情况:
  • 1991年中国科学院优秀期刊三等奖,2000年中国科学院优秀期刊三等奖,1998年中国科技期刊影响因子工程类第二名,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:9060