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玉米MIR基因转录起始位点预测方法研究
  • ISSN号:1000-2340
  • 期刊名称:《河南农业大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:S513[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]河南农业大学农学院,河南郑州450002
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31000714);河南省教育厅自然科学研究计划项目(2010A210020)
中文摘要:

MIR基因是由RNA聚合酶Ⅱ指导转录的,其核心启动子区域具有保守的顺式作用因子,主要是基因-30的TATA和-75的CAAT的特征,开发出一种转录起始位点的预测方法.利用该预测方法,对用深度测序技术获得的玉米胚萌发阶段杂种优势相关miRNA的编码M馏基因进行了顺式作用元件分析,得到了其转录起始位点和启动子区序列特征.同时,利用5’RACE技术对预测的一些转录起始位点进行了验证,证明该预测方法是可行的.

英文摘要:

It is known that MIR genes were transcripted via a RNA polymerase Ⅱ dependent way. Conserved cis action factors existed in the core promoter of MIR genes, including TATA-box in the 30 nt up-stream of transcription starting site and CAAT-box in the 75 nt up-stream of transcription starting site. In this study, a prediction method was developed based on the conserved cis elements analysis of the MIR gene promoter regains. The miRNAs involved in maize seed germination heterosis were analyzed by this method and 5' RACE was proceeded to validate this method, which proved that this method was feasible.

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期刊信息
  • 《河南农业大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:河南农业大学
  • 主办单位:河南农业大学
  • 主编:张改平
  • 地址:郑州市文化路95号
  • 邮编:450002
  • 邮箱:hnndxb@henau.edu.cn
  • 电话:0371-63558885
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-2340
  • 国内统一刊号:ISSN:41-1112/S
  • 邮发代号:36-132
  • 获奖情况:
  • 全国农林类核心期刊,全国优秀科技期刊,河南省优秀科技期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:14872