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中国荷斯坦牛CXCR1基因编码区的遗传多态性

ISSN号：1671-9387
期刊名称：《西北农林科技大学学报：自然科学版》
时间：0
分类：S827.2[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医] Q343.15[生物学—遗传学]
作者机构：[1]四川农业大学动物科技学院,四川雅安625014, [2]山东省农业科学院奶牛研究中心,山东济南250100
相关基金：国家自然科学基金重点项目（30230230）;国家科技支撑计划项目（2008BADA4809）.

作者：官久强[1,2], 王洪梅[2], 王长法[2], 李秋玲[2], 仲跻峰[2], 侯明海[2], 帅素容[1]

关键词：中国荷斯坦牛, CXCR1基因, 遗传多态性, 优势等位基因, Chinese Holstein cattle, CXCR1 gene, genetic polymorphism, predominant allele

中文摘要：

【目的】研究中国荷斯坦牛趋化因子受体1基因（Chemokine（C-X-C motif）receptor1,CXCR1）编码区的遗传多态性。【方法】采用巢式PCR、DNA测序和创造酶切位点法,对中国荷斯坦牛CXCR1基因编码区下游区域的单核苷酸多态位点（Single nucleotide polymorphisms,SNPs）进行筛查,并对筛查到的SNPs进行群体遗传多态性分析。【结果】发现了819（A/G）、995（A/G）和1008（C/T）3个SNPs,其中995（A/G）和1008（C/T）为首次报道的多态位点,995（A/G）位点导致第332位的Arg突变为His。CXCR1基因819（A/G）、995（A/G）和1008（C/T）3个位点在中国荷斯坦牛群体的优势等位基因分别为G、G和C,其等位基因频率分别为0.634 0,0.733 0和0.706 4。经χ^2适合性检验,荷斯坦牛在3个位点均未达到Hardy-Weinberg平衡状态（P〈0.05）;3个位点均表现为中度多态。【结论】中国荷斯坦牛CXCR1基因编码区的遗传多态性比较丰富。

英文摘要：

【Objective】The genetic polymorphism within the coding regions of CXCR1 gene in Chinese Holstein cattle has been detected.【Method】470 of CXCR1 exon of Chinese Holstein cattle were investigated by nested-PCR,DNA sequencing and CRS-PCR.At the same time,the genetic polymorphism of the group was analyzed.【Result】Sequencing results showed that three SNPs were identified,namely 819（A/G）,995（A/G）,1 008（C/T）.819（A/G） and 1 008（C/T） were silent mutations,but 995（A/G） resulted in amino acids alteration Arg332His.In Holstein cattle G and G and C predominant allele were identical at 819（A/G） and 995（A/G） and 1 008（C/T）,which were G,G,C and the allelic frequencies were 0.634 0,0.733 0,0.706 4 respectively.χ^2 test indicated that all polymorphic sites did not meet Hardy-Weinberg equilibrium（P〈0.05） in Chinese Holstein cattle.The value of polymorphism information content indicated that 819（A/G）,995（A/G） and 1 008（C/T）s were moderate polymorphism in Chinese Holstein cattle.【Conclusion】The genetic polymorphism within the coding regions of CXCR1 gene in Chinese Holstein cattle was abundant.

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