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玉米亚基因组中代谢基因的分化研究
  • ISSN号:1004-3268
  • 期刊名称:河南农业科学
  • 时间:2014.2.15
  • 页码:19-23
  • 分类:S513[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]河北联合大学理学院,河北唐山063009, [2]河北联合大学生命科学学院,河北唐山063009
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31100913);河北联合大学青年自然科学基金项目(201230).
  • 相关项目:酵母重复基因间基因置换的统计分析
中文摘要:

为了确定玉米代谢通路中2个亚基因组基因的分化情况,对玉米和高粱进行了共线性分析,确定了玉米的2个亚基因组Maize1和Maize2基因组成,统计了玉米所有407个代谢通路中的亚基因组基因保留情况,并对它们的基因长度进行了双样本均值分析(Z-检验)和通路中2个亚基因组基因保留情况进行χ2检验。结果表明,Maize1、Maize2的基因长度没有显著的差异;基因保留具有显著差异的通路大约占总代谢通路的4.4%,作为亚基因组,Maize2在全局上受到更大基因丢失的影响,有更多的DNA丢失,而Maize1相对保留了更多的代谢基因,拥有更大的表达量。

英文摘要:

In order to understand the differential difference of 2 subgenomes in maize,the colinearity analysis of maize and sorghum was conducted to determine the gene compositon of subgenomes Maize1 and Maize2. The number of subgenomic genes in all the 407 metabolic pathways of maize was counted up. The double-sample mean (Z-test) analysis for the gene length and the ehisquare test for the rentation of two subgenomic genes in the pathways were carried out. The result showed that there was no significant difference of gene length between Maizel and Maize2;the pathways with remarkable difference in gene rentation were about 4.4% in the total metabolic pathways,the Maize2 (as subgenome) had been affected more by gene loss in the global and lost more DNA, while the Maizel relatively reserved more metabolic genes and had more expression level.

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期刊信息
  • 《河南农业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:河南省农业科学院
  • 主办单位:河南省农业科学院
  • 主编:张新友
  • 地址:郑州市花园路116号
  • 邮编:450002
  • 邮箱:hnnykx@163.com
  • 电话:0371-65739041
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-3268
  • 国内统一刊号:ISSN:41-1092/S
  • 邮发代号:36-32
  • 获奖情况:
  • 全国中文核心期刊,全国农业优秀期刊,连续四届被评为河南省优秀期刊...,全国期刊方阵双效期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 英国农业与生物科学研究中心文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:27029