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代谢途径参数估计的智能优化算法比较
  • ISSN号:1001-4160
  • 期刊名称:《计算机与应用化学》
  • 时间:0
  • 分类:N945[自然科学总论—系统科学] TQ033[化学工程]
  • 作者机构:[1]江南大学信息工程学院,江苏无锡214036
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(60474030)
中文摘要:

本文讨论了非线性动力生化过程的参数估计(反问题),以1个包含36个参数的3阶段代谢途径为研究对象,其数学模型描述为受1组非线性代数-微分方程约束的非线性规划问题,由于频繁的病态和多峰值,传统的算法(如梯度算法)并不能得到满意的解。智能优化算法由于其高效性、收敛性和鲁棒性等特点被广泛应用于非线性问题优化,于是提出利用智能优化算法求解代谢途径的参数估计,利用算法的非线性逼近能力,建立求解参数估计的算法模型,采用人工模拟实验值,通过改变已知参数值增加试验次数减少实验误差,将参数编码成算法的1组解向量,以实验值和预测值的误差平方加权的和为目标优化函数。仿真试验表明用量子粒子群算法求解较好,该算法有效地估计了模型中的36个参数,并且成功地完成了对已知模型的预测。

英文摘要:

The parameter estimation(inverse problem) of nonlinear dynamic biochemical pathways which has been stated as a nonlinear programming problem subject to nonlinear differential-algebraic constrains has been discussed.The problem is frequently ill-conditioned and multimodal,traditional(gradient-based) local optimization methods fail to arrive at satisfactory solutions.The use of several intelligent optimization algorithms has been explored.A case study considering the estimation of 36 parameters of a nonlinear biochemical dynamic model has been taken as a benchmark.Quantum-behaved Particle Swarm Optimization algorithm is able to solve the problem successfully has been showed in experiments.

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期刊信息
  • 《计算机与应用化学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院过程工程研究所
  • 主编:王基铭
  • 地址:北京中关村北二街1号
  • 邮编:100080
  • 邮箱:jshx@home.ipe.ac.cn
  • 电话:010-62558482
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-4160
  • 国内统一刊号:ISSN:11-3763/TP
  • 邮发代号:82-500
  • 获奖情况:
  • 1991年中国科学院优秀期刊三等奖,2000年中国科学院优秀期刊三等奖,1998年中国科技期刊影响因子工程类第二名,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:9060