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基于线粒体16S rRNA与COI基因序列的刻肋海胆属系统发育研究
  • ISSN号:1672-5174
  • 期刊名称:《中国海洋大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q244[生物学—细胞生物学]
  • 作者机构:[1]中国海洋大学水产学院,山东青岛266003
  • 相关基金:公益性行业(农业)科研专项(200903005); 国家908专项(908-01-ST12)资助
中文摘要:

本研究以16SrRNA和细胞色素氧化酶I(Cytochrome oxidase subunit I,COI)基因片段序列为标记,以杂色角孔海胆(Salmacis sphaeroides)为外群,基于距离法(NJ)、最大简约法(MP)和最大似然法(ML)分别构建分子系统树,对刻肋海胆属(Temnopleurus)进行了系统发育学研究。结果表明,哈氏刻肋海胆、细雕刻肋海胆、T.alexandri三者亲缘关系较近,芮氏刻肋海胆和T.michaelseni亲缘关系较近。两个基因片段的核苷酸替代速率顺序为COI〉16S rRNA。以3.49%/百万年的核苷酸分歧速率应用于5种海胆的COI基因片段,推断5种海胆分化事件主要发生在约500~590万年前,为中新世晚期(Late Miocene)或上新世早期(Early Pliocene)。

英文摘要:

The partial sequences of mitochondrial compared to study their phylogenetic relationship. COI and 16S rRNA of five genus Temnopleurus were Taking Salrnacis sphaeroides as outgroup, phylogenetic trees were separately constructed based on neighbor-joining, maximum parsimony and maximum likelihood methods. The results showed T. hardwickii,r, toreumaticus and T. alexandri formed into one clade,and there was a closer relationship between T. reevesii and T. michaelseni. Sequence analy- sis indicated that the nucleotide substitution rates of two gene segments was COI 〉16S rRNA. Based on the divergence rate of 3. 49% per million years of COI fragment, their differentiation could happen between 5.0 and 5.90 million years ago,in the Late Miocene or Early Pliocene.

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期刊信息
  • 《中国海洋大学学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:中国海洋大学
  • 主编:管华诗
  • 地址:青岛市松岭路238号
  • 邮编:266100
  • 邮箱:xbzrb@ouc.edu.cn
  • 电话:0532-82032256
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-5174
  • 国内统一刊号:ISSN:37-1414/P
  • 邮发代号:24-31
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),德国数学文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:11624