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稻蝗属部分种类核DNA ITS1区序列系统发育关系
  • ISSN号:0253-2395
  • 期刊名称:山西大学学报(自然科学版)
  • 时间:2014.8.15
  • 页码:429-433
  • 分类:Q961[生物学—昆虫学]
  • 作者机构:[1]山西大学生命科学学院,山西太原030006
  • 相关基金:国家自然科学基金(31170359);山西省自然科学基金(2012011034-4);山西省回国留学人员科研资助项目(2013-020)
  • 相关项目:五倍子蚜分子系统地理学及其与第一和第二寄主植物之间的协同进化
中文摘要:

以核DNA ITSl(Internal Transcribed Spacer 1)序列作为分子标记,对我国稻蝗属部分物种种间相互关系进行初步探讨。对获得的7种稻蝗ITSl区序列进行同源性比较、核苷酸使用频率和变异住点统计计算,分析种间核DNA变异,并用芋蝗作为外类群构建NJ和MP分子系统进化树。实验共获得ITSl序列381bp,其中变异位点48个,占所测序列的12.6%,碱基组成分析显示AT含量低于GC含量,与mtDNA富含AT的特征明显不同;核苷酸变异位点统计结果显示,稻蝗属不同种间核苷酸替换数最高为36个,发生在小稻蝗与山稻蝗之间,变异率达11.18%;而无齿稻蝗与短翅稻蝗具有相同的ITSl区序列,彼此之间没有变异。系统发育树显示,小稻蝗和其他稻蝗之间的关系相对较远,是分化较大的种类;日本稻蝗和海南稻蝗与山稻蝗、短翅稻蝗和无齿稻蝗与中华稻蝗关系较近,分别构成一个聚类簇;但是两两种之间的聚类置信度不高,种间关系还有待进一步澄清。

英文摘要:

The molecular phylogeny of Oxya species were investigated by sequencing the ribosomal DNA (rDNA) ITS1 sequences. We obtained 381bp sequences in length for the seven Oxya species and one out- group species Gesonula punctifrons. The sequences were compared, the nucleotide frequency calculated, and the molecular phylogenetic trees were constructed by NJ and MP methods using G. punctifrons as out- group. The results showed that: (1) the sequence of ITS1 included 48 variable sites (about 12.60%) and showed higher GC content than AT, which was significantly different from mtDNA sequence with much higher AT preference;(2) the largest nucleotide variation was found between O. intricata and O. agavisa with 36 variable sites(about 11.18%),and no mutation between O. adentata and O. brachyptera; (3) the phylogenetic trees showed that O. hainanensis, O. japonica and O. agavisa was closely clustered; O. brachyptera,O, adentata and O. chinensis have close relationship;O, intricata was obviously remote from other species. In total, the more markers and samples were necessary to further examine the relationship a- mong Oxya species.

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期刊信息
  • 《山西大学学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:山西省教育厅
  • 主办单位:山西大学
  • 主编:杨斌盛
  • 地址:太原市坞城路92号
  • 邮编:030006
  • 邮箱:xbbjb@sxu.edu.cn
  • 电话:0351-7010455
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-2395
  • 国内统一刊号:ISSN:14-1105/N
  • 邮发代号:22-42
  • 获奖情况:
  • 边疆七年获山西省一级期刊荣誉(1993-1999)
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:5651