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不同抗性淀粉含量的小麦品种(系)SBEⅡa基因启动子序列分析
  • ISSN号:1007-7383
  • 期刊名称:石河子大学学报(自然科学版)
  • 时间:2015.2.6
  • 页码:60-66-
  • 分类:S512.1[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]石河子大学农学院、新疆兵团绿洲生态农业重点实验室,石河子832003, [2]石河子大学医学院、新疆地方病与民族高发病实验室,石河子832002
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31160279,31260357)
  • 相关项目:VIGS诱导小麦淀粉合成基因沉默及对抗性淀粉合成的影响
中文摘要:

为了从分子水平上揭示不同小麦品种(系)间抗性淀粉含量差异的原因,本试验利用q RT-PCR技术研究了抗性淀粉含量高和抗性淀粉含量低的小麦品种(系)淀粉合成关键基因SBEⅡa表达差异。根据Genebank中公布的小麦SBEⅡa基因启动子(AY357072.1)基因序列设计特异性引物,利用RT-PCR技术克隆SBEⅡa基因启动子,利用Clustal.W对测序结果比对分析,利用数据库PLACE和Plant CARE对启动子序列中各特征元件进行预测,以发掘影响SBEⅡa基因表达量的重要作用元件的等位变异位点。结果显示:抗性淀粉含量高的小麦品种(系)中SBEⅡa基因的表达量低于抗性淀粉含量低的品种(系)。克隆了10个抗性淀粉含量不同的小麦品种(系)SBEⅡa基因编码区上游2896 bp序列,10个小麦品种(系)SBEⅡa基因启动子序列相似性达到了99.92%,抗性淀粉含量高和抗性淀粉含量低的小麦品种(系)SBEⅡa基因启动子序列间无规律性差异。推测,SBEⅡa基因启动子可能不是造成SBEⅡa基因表达差异的主要原因。

英文摘要:

In order to explore the molecular mechanism that different spring wheat cultivars show significantly differences in RS(resistant starch,RS) content,we studied the gene expression profiles of SBEⅡ a which is a key gene controlling starch synthesis between cultivars and two low RS conent cultivars of spring wheat by quantitative real-time RT-PCR(q RT-PCR) technique.Special primers were designed according the sequence of AY357072.1 deposited in Gen Bank,and the partial sequence of SBEⅡ a gene promoter was cloned using reverse transcription polymerase chain reaction(RT-PCR) from wheat.The nucleotide sequences were blasted by Clustal.W software,and the regulatory elements were predicted by PLACE and Plant CARE, respectively.The results showed that the relative expression level of SBEⅡ a in high RS spring wheat cultivars was significantly lower than in the low RS cultivars.The promoter of SBEⅡ a gene from ten spring wheat cultivars was 2896 bp,The sequence analysis showed that the promoter region of SBEⅡ a genes from different spring wheat cultivars reached 99.92% similarity with AY357072.1.The results indicated that there were little allelic sites mutation,and only single-base mutation,Indel or insert in a single spring wheat cultivar.As a result,the promoter of SBEⅡ a gene might not cause the different relative expression level of SBE a gene in different spring wheat cultivars.

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期刊信息
  • 《石河子大学学报:自然科学版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:
  • 主办单位:石河子大学
  • 主编:向本春
  • 地址:新疆石河子市北四路
  • 邮编:832003
  • 邮箱:xuebaozrb@shzu.edu.cn
  • 电话:0993-2058977
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-7383
  • 国内统一刊号:ISSN:65-1174/N
  • 邮发代号:58-174
  • 获奖情况:
  • 2006、2008、2010、1012年荣获“首届中国高校特色...,在新疆第三次优秀科技期刊评比中荣获新疆科技期刊...,在第四、五、六、七次获综合效益奖及二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊
  • 被引量:8226