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利用DSN和SMART^TM技术构建金龟子绿僵菌产孢时期均一化全长cDNA文库
  • ISSN号:1674-7968
  • 期刊名称:《农业生物技术学报》
  • 时间:0
  • 分类:S188[农业科学—农业基础科学]
  • 作者机构:[1]重庆大学生物工程学院基因工程研究中心,重庆市杀虫真菌农药工程技术研究中心,功能基因及调控技术重庆市重点实验室,重庆400030
  • 相关基金:国家自然科学基金(No.30170630)和重庆市重点自然科学基金(No.8564)资助.
中文摘要:

为高效获得与绿僵菌产孢相关的全长cDNA,采用DSN(duplex-specific nuclease)均一化技术与SMART^TM(switching mechanism at 5′end of RNA transcript)建库技术相结合的方法,构建了杀虫真菌金龟子绿僵菌(Metarhizium anisopliae var.acridum)菌株CQMa102产孢时期的均一化全长cDNA文库。经检测,原始文库滴度为2.1×10^6cfu/mL,库容量超过6×10^6。随机挑取100个克隆,PCR方法测得文库重组率大于95%,插入片段平均长度1500bp。小规模测序分析表明,全长基因的比例超过60%。对组成性表达基因3-磷酸甘油醛脱氢酶G3PDH和微管蛋白β-tubulin均一化前后丰度检测表明,其丰度均有大幅度的下降,基本满足节约筛库的要求。

英文摘要:

In order to obtain full-length genes related to sporulation in Metarhizium anisopliae var. acridum CQMa102, a normalized cDNA library enriched in full-length sequences was constructed using DSN (duplex-specific nuclease)-normalization method combined with SMART^TM (switching mechanism at 5′end of RNA transcript) technique. The titer of un-amplified cDNA library was about 2.1×10^6 cfu/mL and contained 6×10^6 independent clones. The average cDNA inserts size was 1 500 bp with a recombination rate of 95%. Sequencing results and bioinformatics analysis of random picked clones showed that the ratio of full-length cDNA was about 60%. The abundance of transcripts G3PDH and β-tubulin decreased obviously compared with non-normalized samples. These results indicated that the normalized full-length cDNA library has been constructed successfully, which is convenient for further studyins the sporulation mechanism in Metarhizium.

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期刊信息
  • 《农业生物技术学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:中国农业大学
  • 主编:武维华
  • 地址:北京市海淀区圆明园西路2号中国农大生命科学楼1053
  • 邮编:100193
  • 邮箱:nsjxb@cau.edu.cn
  • 电话:010-62733684 62731615
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-7968
  • 国内统一刊号:ISSN:11-3342/S
  • 邮发代号:2-367
  • 获奖情况:
  • 在《中国学术期刊评价研究报告》(2009-2010年)...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国乌利希期刊指南,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:15081