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系统生物学研究中不同组学数据的整合
  • ISSN号:1007-7626
  • 期刊名称:《中国生物化学与分子生物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q50[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]国防科技大学机电工程与自动化学院,长沙410073, [2]蛋白质组学国家重点实验室,北京蛋白质组中心,军事医学科学院放射与辐射医学研究所,北京102206
  • 相关基金:国家重点基础研究发展规划(973计划,No.2006CB910803,2006CB910706),国家高技术研究发展计划资助项目(863计划,No.2006AA02A312),创新研究群体科学基金项目(No.30621063)
中文摘要:

高通量实验方法的发展导致大量基因组、转录组、代谢组等组学数据的出现,组学数据的整合为全面了解生物学系统提供了条件.但是,由于当前实验技术手段的限制,高通量组学数据大多存在系统偏差,数据类型和可靠程度也各不相同,这给组学数据的整合带来了困难.本文以转录组、蛋白质组和代谢组为重点,综述了近年来组学数据整合方面的研究进展,包括新的数据整合方法和分析平台.虽然现存的数据统计和网络分析的方法有助于发现不同组学数据之间的关联,但是生物学意义上的深层次的数据整合还有待于生物、数学、计算机等各种领域的全面发展.

英文摘要:

The development of high-throughput experimental techniques has led to the emergence of a large amount of omics data, including transcriptome, proteome and metabonome data. Integrating such omics data provided a chance to comprehend the biological system fully. However, there were systematic biases in high-throughput data due to the limit of experimental technique, and data types and reliability degree varied in different omics data, which brought difficulties to the integration of different omics data. In this paper, we focused on transcriptome, proteome and metabonome to review the progress in the area of omics data integration in the recent years, including new methods and analysis tools. Even though the existing approaches of data statistic and network analysis could help uncover the relationship among different omics data, thorough integration of data from the biological aspect would depend on the further development in multiple areas, such as biology, mathematics and computer.

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期刊信息
  • 《中国生物化学与分子生物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国生物化学与分子生物学会 北京大学
  • 主编:周春燕
  • 地址:北京市学院路38号北京大学医学部
  • 邮编:100083
  • 邮箱:shxb@bjmu.edu.cn
  • 电话:010-82801416
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-7626
  • 国内统一刊号:ISSN:11-3870/Q
  • 邮发代号:82-312
  • 获奖情况:
  • 被美国《CA》列入世界引用频次最高的《千种表》
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:9731