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运用关联分析定位栽培大豆蛋白11S、7S组分的相关基因位点
  • ISSN号:0496-3490
  • 期刊名称:作物学报
  • 时间:0
  • 页码:820-828
  • 分类:S512.1[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]河南省农业科学院经济作物研究所/国家大豆改良中心郑州分中心/农业部黄淮海油料作物重点实验室,河南郑州450002, [2]河南农业大学生命科学院,河南郑州450002
  • 相关基金:本研究由国家自然科学基金项目(30971818,30771360),国家转基因生物新品种培育重大专项(2011ZX08004-003),河南省创新型科技人才队伍建设工程(094100510004)和郑州市创新型科技人才队伍建设:[程(096sYJH14103)资助.
  • 相关项目:大豆蛋白质含量相关基因精细定位及其功能多态序列的发掘
中文摘要:

大豆贮藏蛋白主要成分是7S和11S球蛋白,大豆贮藏蛋白组分及其亚基组成决定了蛋白质的品质和加工特性。本研究选用134对细胞核SSR标记,对166份栽培大豆微核心种质进行基因分型,运用一般线性回归(general linear model,GLM)和复合线性回归(mixed linear model,MLM)方法进行标记与性状的关联分析,定位大豆蛋白亚基的相关基因。结果表明,2年均检测到的且与蛋白亚基相关联的SSR位点有14个,以MLM方法检测到5个SSR位点(Sat_062、Satt583、Satt291、Satt234和Satt595)与蛋白亚基相关联;7S组分各亚基变异程度较大,是引起11S/7S变异的主要原因;表型变异较大的亚基可能因为相关基因进化中发生重组较多,LD衰减距离较小,导致检测到较少的相关位点。本研究结果对蛋白亚基相关性状的标记辅助选择育种有重要的利用价值。

英文摘要:

Glycinin (11S) and β-conglycinin (7S) are major components of seed storage protein in soybean, which play important roles in the functionality of seed protein. In the present study, association mapping was used to map the QTLs (quantitative trait loci) for glycinin (1 IS) and ~-conglycinin (7S) fractions. One hundred and sixty-six accessions from Chinese soybean minicore collection were genotyped with 134 selected simple-sequence repeat (SSR) markers. The storage protein of each accession was separated by SDS-PAGE method, and gels were scanned for individual subunits of 11S and 7S by ImageQuant TL software. The association analysis between SSR loci and protein subunit components was performed with TASSEL GLM (general linear model) and MLM (mixed linear model) programs. The results showed that, both in 2008 and 2010, fourteen SSR loci associated with the protein subunit components were screened out by GLM program, and five SSR (Satt234, Satt595, Sat_062, Satt583, and Satt291) loci by MLM program, respectively. The high variation of 7S subunits was the main reason that caused 11S/7S ratio variance. Fewer loci were detected to be associated with the protein subunits whose phenotypic variations were higher, which might be due to the more recombination incidents during the evolution of the related genes. Therefore, the LD decay distances of these genes were short, some QTLs could not be detected with limited SSR markers. The results of this study are meaningful for the marker assisted selection breeding of soybean varieties with higher protein quality.

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期刊信息
  • 《作物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国作物学会 中国农业科学院作物科学研究所
  • 主编:万建民
  • 地址:北京海淀区中关村南大街12号中国农业科学院
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zwxb301@caas.cn
  • 电话:010-82108548
  • 国际标准刊号:ISSN:0496-3490
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1809/S
  • 邮发代号:82-336
  • 获奖情况:
  • 2002年-第三届中国科协优秀科技期刊二等奖,2002-2009年-百种中国杰出学术期刊,2004年获“全国优秀期刊一等奖”,2005年获第三届国家期刊奖提名奖,2009年评为“2008年度中国精品科技期刊”,2009年被评为“新中国60年有影响力的期刊”,2011年获"第二届中国出版政府奖期刊奖提名奖"
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:49369