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一种新的基于两序列比对的ncRNA基因识别模型
  • ISSN号:1672-5565
  • 期刊名称:生物信息学
  • 时间:0
  • 页码:332-341
  • 语言:中文
  • 分类:TP391[自动化与计算机技术—计算机应用技术;自动化与计算机技术—计算机科学与技术] O235[理学—运筹学与控制论;理学—数学]
  • 作者机构:[1]国防科技大学计算机学院,湖南长沙410073
  • 相关基金:湖南省自然科学基金(编号:06114123),国家自然科学基金(编号:60673018)
  • 相关项目:大规模RNA二级结构预测算法及其并行化研究
中文摘要:

利用上下文相关隐Markov模型建立neRNA基因基本二级结构模型,从两序列比对结果中提取序列相似性信息,并把该信息引入基本的上下文相关Markov模型中,从而构建出新的neRNA基因识别模型。

英文摘要:

This paper uses context- sensitive hidden markov for basic ncRNA secondary structure,and distills similarity information from result pair- wise alignment of two sequences that is close in evolutionary distance. Then we introduce the idormafion into the basic secondary structure model and get the novel ncRNA gene finding model consequently.

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期刊信息
  • 《生物信息学》
  • 主管单位:中华人民共和国工业和信息化部
  • 主办单位:哈尔滨工业大学
  • 主编:任南琪
  • 地址:哈尔滨市南岗区西大直街92号136信箱
  • 邮编:150001
  • 邮箱:swxxx@hit.edu.cn
  • 电话:0451-86414260
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-5565
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1513/Q
  • 邮发代号:14-14
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 被引量:1292