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人参达玛烷二醇合成酶基因的克隆、序列特征和组织表达分析
  • ISSN号:1000-5684
  • 期刊名称:《吉林农业大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学] S567.51[农业科学—中草药栽培;农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]吉林农业大学中药材学院,长春130118
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31270371); 国家科技支撑计划项目(2011BAI03B01-02); 吉林省科技发展计划项目(20125068)
中文摘要:

以五年生人参根组织为试验材料,利用RT-PCR方法克隆人参DS基因序列;通过生物信息学技术对其核苷酸序列和氨基酸序列进行比对;运用实时荧光定量PCR技术检测DS基因在人参根、茎、叶、果各部位的表达量。结果表明:获得人参DS基因c DNA全长,其核苷酸序列长为2.385 kb,含有1个开放阅读框,编码769个氨基酸多肽。生物信息学分析显示DS编码蛋白质包含1个跨膜区域,具有3个保守结构域。人参DS编码蛋白质与西洋参的DS(AGK62449)和三七的DS(AGI19258)具有99%的序列相似性。实时荧光定量PCR显示,DS基因在人参根、茎、叶、果各部位均有表达,在叶中表达量最高,其次是在果中,在根和茎中表达量相近。

英文摘要:

Five-year-old ginseng root tissue was used for cloning DS gene by RT-PCR technology.Nucleotide and amino acid sequences were compared by bioinformatics technology. DS gene expression levels in roots,shoots,leaves and fruits of P. ginseng were detected by real-time quantitative PCR. Full-length c DNA of DS was 2. 385 kb which included an open reading frame( ORF) encoding 769 amino acid peptide. Bioinformatic analysis showed that DS-encoding protein contained one transmembrane region and three conserved domains. Protein sequence of P. ginseng DS had the highest sequence similarity( 99%) with P. quinquefolius DS( AGK62449) and P. notoging DS( AGI19258). Real-time quantitative PCR showed that DS gene was expressed in all the detected tissues. Expression level of P. ginseng DS was the highest in leaves,followed by fruits. Roots and shoots had a similar quantitative expression.

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期刊信息
  • 《吉林农业大学学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:吉林省教育厅
  • 主办单位:吉林农业大学
  • 主编:秦贵信
  • 地址:吉林省长春市新城大街2888号
  • 邮编:130118
  • 邮箱:jlndxb@vjlav.edu.cn
  • 电话:0431-84532914
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-5684
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1100/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 全国优秀科技期刊,全国中文农业类核心期刊,中国科技论文统计源期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:16398