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阿尔茨海默症miRNA靶基因预测研究
  • ISSN号:1000-2243
  • 期刊名称:《福州大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q343.1[生物学—遗传学]
  • 作者机构:[1]上海海事大学信息工程学院,上海201306, [2]美国罗文大学生物化学系,新泽西08028
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(61271446;61003093)
中文摘要:

为深入了解阿尔茨海默症的发病机制,利用匹配的基因表达数据和miRNA表达数据,对miRNA的靶基因进行预测分析.首先对选择出的差异表达miRNA进行靶基因预测;然后利用HCTarget算法验证预测的靶基因;最后对miRNA及其靶基因构建调控网络.调控网络中包含11个已确定的与AD有关的miRNA及6个AD致病基因.通过分析网络发现miRNA及其靶基因在正常与患病两种情况下的活性变化趋势,生物学分析也证实了它们在AD中的重要作用,为AD发病机制研究提供了依据.

英文摘要:

The research of miRNAs will help to further understand the pathogenesis of Alzheimer's disease. In this paper,we use matching gene expression data and the miRNA expression data to estimate and analyze the miRNAs' target genes. First we estimate the target genes of the chosen differentially expressed miRNAs. Then we use HCTarget algorithm to validate the forecast target genes. At last we built regulation network of miRNAs and its target genes. The regulation network contains 11 identified miRNAs associated with AD and 6 AD disease- causing genes. By analyzing the network we found the miRNAs and its target genes' active trend in two cases of AD: normal and disease,biological analysis also confirmed their important role in the AD,this provided the basis for the research of the pathogenesis of AD.

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期刊信息
  • 《福州大学学报:自然科学版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:福州大学
  • 主办单位:福州大学
  • 主编:杨黄浩
  • 地址:福建省福州市大学新区学园路2号
  • 邮编:350116
  • 邮箱:xb@fzu.edu.cn
  • 电话:0591-22865030 22865031
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-2243
  • 国内统一刊号:ISSN:35-1117/N
  • 邮发代号:34-27
  • 获奖情况:
  • 全国高校优秀自然科学学报,华东地区优秀期刊,福建省优秀科技期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),德国数学文摘,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:8994