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16S rDNA序列测定在口腔疾病的应用特点综述
  • ISSN号:1671-7651
  • 期刊名称:口腔医学研究
  • 时间:2014.10.28
  • 页码:1010-1012
  • 分类:R780.2[医药卫生—口腔医学;医药卫生—临床医学]
  • 作者机构:[1]兰州大学口腔医学院,甘肃兰州730000, [2]西北民族大学口腔医学国家民委重点实验室,甘肃兰州730030
  • 相关基金:国家自然科学基金地区基金项目(31360124/C0309,31160124/C0309)
  • 相关项目:甘肃特有少数民族口腔微生物群落结构与牙周炎发病的关系研究
中文摘要:

目的:研究甘肃保安族口腔健康儿童唾液微生物群落结构,探寻优势微生物种群。方法:通过构建16S rRNA克隆文库法对测序结果进行分析,利用BLAST、Mothur、Clustalx 2.0等软件进行细菌群落结构多样性分析,构建系统发育树。结果:共检测到84个操作分类单位(OTU),归属于5个门,12个纲,15个目,18个科,19个属。其中以厚壁菌门(Firmicutes,88.60%)比例最多;6个优势菌属(检出率〉1%),分别为链球菌属(Streptococcus,70.28%)、颗粒链菌属(Granu Iicatella,6.20%)、孪生菌属(Gemella,3.10%)、韦永氏球菌属(Veillonella,1.81%)、奈瑟菌属(Neisseria,1.03%)和嗜血杆菌属(Haemophilus,1.03%),其中链球菌属在8个样本中均出现。结论:保安族口腔健康儿童唾液微生物群落结构较为丰富;链球菌属为主要优势菌。

英文摘要:

AIM:To explore the dominant salivary microbiota in healthy children of Bonan ethnic group of Gansu province.METHODS:16S rRNA clone library was constructed to analyze the sequencing results.The analysis of diversity of bacterial community structure was conducted by BLAST,Mothur and Clustalx2.0.Phylogenetic tree was constructed.RESULTS:84 operational takonomic units(OTUs)were detected which belonged to 5 phyla,12 classes, 15 orders,18 families and 19 genera.Firmicutes was the most prominent (88.60%)species.6 genera were at high a-bundance (detection rate 〉1%):Streptococcus (70.28%),GranuIicatella (6.20%),Gemella(3.10%),Veillonel-la(1.81%),Neisseria(1.03%)and Haemophilus(1.03%).Streptococcus was detected in all 8 samples.CONCLU-SION:The salivary microbial community structure of healthy children of Bonan ethnic group is abundant.Streptococcus is the dominant bacteria.

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期刊信息
  • 《口腔医学研究》
  • 北大核心期刊(2014版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:武汉大学口腔医学院
  • 主编:樊明文
  • 地址:武汉市武昌珞瑜路237号
  • 邮编:430079
  • 邮箱:kqyxyj@163.com
  • 电话:027-87686117
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-7651
  • 国内统一刊号:ISSN:42-1682/R
  • 邮发代号:38-119
  • 获奖情况:
  • 国家科技部中国科技论文统计源期刊,中国科学引文数据库来源期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:11733