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一种基因本体术语间的语义相似度计算方法
  • ISSN号:1007-130X
  • 期刊名称:计算机工程
  • 时间:0
  • 页码:209-210
  • 语言:中文
  • 分类:TP311[自动化与计算机技术—计算机软件与理论;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构:[1]井冈山大学信息科学与传媒学院,江西吉安343009, [2]同济大学电子与信息工程学院,上海201804
  • 相关基金:国家自然科学基金(No.70771077);国家高技术研究发展计划(863)No.2008AA042106).
  • 相关项目:基于语义的新一代决策支持系统关键问题研究
作者: 向阳|魏韡|
中文摘要:

计算基因本体中的术语的语义相似度是基因本体的一个重要应用。基于信息量和基于距离的语义相似度计算方法都只从各自的角度计算术语间语义相似度。提出了基于基因本体中术语所在有向无环图的计算方法。该方法既考虑了术语的祖先对其的信息量的影响,又考虑了术语所在的位置以及术语问的语义联系类型。实验结果表明该方法有较高的准确度。

英文摘要:

Calculating the semantic similarity of GO terms is an important application of GO.The information content based and the distance based method only calculate the semantic similarity of terms respectively.This paper proposes a method of directed acyclic graphs of terms to measure the semantic similarity of GO terms.The method not only considers the contribution of ancestor related terms, but also considers the location of term and the semantic relation of terms.Experimental results show that method has higher degree of accuracy.

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期刊信息
  • 《计算机工程与科学》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:国防科学技术大学
  • 主办单位:国防科学技术大大学计算机学院
  • 主编:王志英
  • 地址:湖南长沙德雅路109号
  • 邮编:410073
  • 邮箱:jsjgcykx@163.net
  • 电话:0731-84576405
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-130X
  • 国内统一刊号:ISSN:43-1258/TP
  • 邮发代号:42-153
  • 获奖情况:
  • 湖南省优秀期刊,首届国防科技期刊优秀期刊,《CAJ-CD规范》执行优秀期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 英国科学文摘数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:16422