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大规模单核苷酸多态性位点验证的集群解决方案
  • ISSN号:1001-3695
  • 期刊名称:《计算机应用研究》
  • 时间:0
  • 分类:TP301[自动化与计算机技术—计算机系统结构;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构:[1]清华大学生物科学与技术系,北京100084, [2]清华大学生命科学与医学研究院,北京100084, [3]清华大学教育部生物信息学重点实验室,北京100084, [4]国家人类基因组北方中心,北京100176
  • 相关基金:国家“863”计划资助项目(2002AA234011A);国家自然科学基金资助项目(90412018);教育部科学技术研究重大项目(03180);“跨世纪人才培养计划”基金资助项目;致谢:本项目是由清华大学教育部生物信息学重点实验室与北京国家人类基因组北方中心合作完成的.集群系统由国家人类基因组北方中心提供.
中文摘要:

随着高通量的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)检测技术的发展,世界各地的实验研究积累了大量的SNP数据,但是目前尚无一个全面综合的SNP数据库。SNP在致病基因发现、司法鉴定、个体化医疗等方面的应用得到了极大的关注和发展,因此有必要建立一个整合的人类SNP数据库。在整合中需要进行大规模的单核苷酸多态性位点的验证,该工作通过一个自主开发的、健壮的、用户友好的生物信息学集群计算工具包EasyCluster在集群系统上得以高效完成。

英文摘要:

Along with the development of detection technologies of Single Nueleotide Polymorphism (SNP), vast amount of SNP data has been accumulated all over the world. However, there is no integrated SNP database heretofore. Because of the significance of SNPs in gene finding, judicial identifying, personal treatment, etc. , an integrated SNP database is in great demand. In the integration process, large-scale SNP validation is required and proceeded on a cluster system facilitated by an independently developed, robust and user-friendly toolkit called EasyCluster.

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期刊信息
  • 《计算机应用研究》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:四川省科学技术厅
  • 主办单位:四川省计算机研究院
  • 主编:刘营
  • 地址:成都市成科西路3号
  • 邮编:610041
  • 邮箱:arocmag@163.com
  • 电话:028-85210177 85249567
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-3695
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1196/TP
  • 邮发代号:62-68
  • 获奖情况:
  • 第二届国家期刊奖百种重点科技期刊,国内计算技术类重点核心期刊,国内外著名数据库收录期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,波兰哥白尼索引,英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:60049