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Tobramycin与16SrRNAA位点复合物的分子动力学模拟
  • ISSN号:0251-0790
  • 期刊名称:《高等学校化学学报》
  • 时间:0
  • 分类:S855.3[农业科学—临床兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]Modern Biological Research Center, Yunnan University, Kunming 650091, China, [2]Henan Medical School, Kaifeng 475300, China, [3]Tangdu Hospital, Fourth Military Medical University, Xi'an 710033, China, [4]Deparment of Cell Biology and Medical Genetics, Kunming Medical College, Kunming 650031, China, [5]Kunming Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences, Kunming 650223, China, [6]Center for Theoretical Biology, Peking University, Beijing 100871, China
  • 相关基金:Supported by the National Natural Science Foundation of China (Grants No. 90208018, 39970412 and 90303018) and the CAS Knowledge Innovation Project Cross-Frontier Project (No. KJCXI-08)
中文摘要:

这里,我们在偏爱和 mRNA secondary 上报导鳕鱼红血球凝聚素的结构的特征(哈) 劈开地点鸟的流行性感冒病毒 H5N1 子类型的基本氨基酸区域。我们开发了动态扩大合拢的策略在反复的扩展进程用 RNAstructure 4.1 节目预言 RNA 第二等的结构。序列的统计分析证明 HA 劈开地点基本氨基酸宠爱充满腺嘌的鳕鱼 ons,和相应 mRNA 碎片主要处于搁浅单人赛的环的合拢的状态。我们的顺序、结构的分析显示了那阻止并且控制这些高度病原的病毒,也就是说禁止鸟的流行性感冒病毒 H5N1 子类型的基因表示,我们应该作为 RNA 干扰的目标认为 HA 劈开的搁浅单人赛的环区域是编码地点的序列。

英文摘要:

Here we report the codon bias and the mRNA secondary structural features of the hemagglutinin (HA) cleavage site basic amino acid regions of avian influenza virus H5N1 subtypes. We have developed a dynamic extended folding strategy to predict RNA secondary structure with RNAstructure 4.1 program in an iterative extension process. Statistical analysis of the sequences showed that the HA cleavage site basic amino acids favor the adenine-rich codons, and the corresponding mRNA fragments are mainly in the folding states of single-stranded loops. Our sequential and structural analyses showed that to prevent and control these highly pathogenic viruses, that is, to inhibit the gene expression of avian influenza virus H5N1 subtypes, we should consider the single-stranded loop regions of the HA cleavage site-coding sequences as the targets of RNA interference.

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期刊信息
  • 《高等学校化学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:吉林大学 南开大学
  • 主编:周其凤
  • 地址:吉林大学南胡校区
  • 邮编:130012
  • 邮箱:cjcu@jlu.edu.cn
  • 电话:0431-88499216
  • 国际标准刊号:ISSN:0251-0790
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1131/O6
  • 邮发代号:12-40
  • 获奖情况:
  • 首届及第二届国家期刊奖,连续两届“百种中国杰出学术期刊”,中国期刊方阵“双高”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,美国科学引文索引(扩展库),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:50676