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组蛋白去乙酰化酶抑制剂影响肿瘤进程相关基因的生物信息学分析
  • ISSN号:1674-568X
  • 期刊名称:《基因组学与应用生物学》
  • 时间:0
  • 分类:Q[生物学]
  • 作者机构:[1]吉林大学基础医学院医学遗传学教研室,长春130021, [2]吉林大学基础医学院医学免疫学教研室,长春130021
  • 相关基金:本研究由“在单核巨噬细胞分化发育过程中激活素A的作用及其机制研究”项目(81273199)资助
中文摘要:

肿瘤是一种威胁人类身体健康的常见病和多发病,很难治愈。目前,组蛋白去乙酰化酶抑制剂(HDACi)已经作为靶向治疗研究的新热点,恩替诺特(Entinostat)等HDACi已经开始应用于肿瘤治疗的临床试验阶段,但是其作用机制尚不明确。本试验通过Pubmed等数据库进行文献检索,利用DAVID进行GO分析以及Cytoscape等多种数据库进行数据处理、挖掘,得到HDACi肿瘤相关基因的调控网络及代谢路径。经过相关分析,得到的HDACi肿瘤关联基因的功能作用模块,这将为HDACi作用机制的预测和今后开拓HDACi肿瘤治疗的研究提供依据,同时也为寻找HDACi的辅助药物提供了指导。

英文摘要:

Cancer is a common and frequently-occurring disease that threatens human health and is hard to cure. Currently, HDACi has become a new hot spot in targeted therapy research. Entinostat and some other HDACi have been used in clinical stages of cancer treatment, but their mechanism for cancer therapy is still not clear. In this study, we searched the literature through databases such as Pumed, did the GO analysis through DAVID, and used database such as Cytoscape for data processing and mining, from which we obtained the regulatory networks and metabolic pathways of HDACi-related tumor genes. After correlation analysis, we obtained the functional modules of HDACi-related tumor genes, which would provide a basis for predicting the mechanism of HDACi and exploring the research of HDACi oncotherapy, and meanwhile it would also provide the guidance for finding the ancillary drug of HDACi.

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期刊信息
  • 《基因组学与应用生物学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广西大学
  • 主办单位:广西大学
  • 主编:朱玉贤
  • 地址:广西南宁市大学东路100号广西大学西校园《基因组学与应用生物学》编辑部111室
  • 邮编:530004
  • 邮箱:gab@hibio.org 571388455@qq.com
  • 电话:0771-3239102
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-568X
  • 国内统一刊号:ISSN:45-1369/Q
  • 邮发代号:48-213
  • 获奖情况:
  • 全国优秀高校学校自然科学学报,教育部优秀科技期刊,广西优秀科技期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:4299